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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00336



RNA: SRP_00336
Rfam family: -

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((((....))))..))..))))(((((((((.......((((.(((((((((((((.((((((....)))))).((((((((....(((((((((((((((((....................)))).(((((...(((((..(((....)))...))))).....)))))....)))))))..)))))).....))))).))).........(((........))))))))))))..))))....)))).......))))))))).......
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.......................))).((((((((.......((((.......((((((.(((...(((((.(((.((((((((((....(((((((.(((((((..((..............))..)))))))..........(((......(((....(((....)))....)))....)))...))))))).....)))).))...)))).))).))).))..)))...))))))............)))).......))))))))........
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.............(((..)))..[[[[[[[[[.......[[[[.....[[[[[[[[[[[[[[[[[(((((((((((..................((((((((.((((......)))).......)))))))).......))))))..)))))))))))........]]]]]........((((...)))).........((((.(((((..)))))))))...]]]]..]]]]]]]]..........]]]].......]]]]]]]]].......
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((([[[[.)))]]]]......))))(((((((((.......((((.(((((((((((((((((((...)))......(((((((......(((((.((((((((......................)))))))))).)))...)))))))...(((..(((........)))..))).(((((((...)))).))).....((((.((((....))))))))...))))..))))))))..))))....)))).......))))))))).......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.....................))))(((((((((.......((((.(((((((((((((........(((((....((((.((((...(((((...((((((((.((((......)))).......))))))))...(((((.((((...))))...))))).........)))))..)))).))))..............((((.((((....))))))))...))))))))))))))..))))....)))).......))))))))).......
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....)))....(....)))))(((((((((..(.((.((((.(((((..(((((((..(((((((.((((...(((((((......(((((.((((((((..((...((....))...))..)))))))))).)))...)))))))))))))....((....)))))))(((..((((((.....))).))).....((((.((((....))))))))..)))))..)))))..)..))))....))))..)))..))))))))).......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.....(((.....(((..)))((((..)))).).))(((((((((((.(..(((((((((..((((((((((((((((((.(.((...(((((.(((((....((((......))))...)...((..((((((..))).))))).)))))).)))....)).))))).))))).)))))))).)..))).))))))))))))))))))(((((((((..)...(......)....).))))))).......))))).).(........)....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.....))).........(((..(((((((((..(.((.((((.(((((..(((((((((.(.(((((.(((.((((((((((....(((((((.....((........(......)........)).................((......))..............................))))))).....))))).))...))).))).))).)).)))))..)))))..)..))))....))))..)))..)))))))))..)))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.....))).........(((..(((((..((....((.((((.(((((..(((((((((.(((((((.(((...(((((((......(((((.((((((((..((...((....))...))..)))))))))).)))...))))))))))(((...(((....))).....)))...))))).)).............((((.((((....))))))))...))))..)))))..)..))))....))))..))...))..)))))..)))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.....)))...((((.........))))..((((......)))).......(((((((((((......))))).(((((((..(((.........)))..((((....)))).((((..((..........))..)))).)))))))........))))))....((((..............)))).........((((...((((....))))..((((.....)))).((((.................))))...))))..........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((.....)))....(((...aaaa..))).((((......((((.(((.....<<<<)))..(((>>>>)))))))AAAA.(((((((.....[[[[)))..((((....)))).....)))).))))..(((((..{{{{.)))))...((((..}}}}.......)))).........(((.....)))..]]]].((((...((((....))))..((((.....)))).((((.................))))...))))..........