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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00338



RNA: SRP_00338
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))...))
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))).......
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((..(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))...))).))))))...))))))))....
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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((..((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).)...)))))))...))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((..(.(((....)))..).))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((...((((..[[[[[[..)))).....(((.....(((....))).....)))...(((((..]]]]]]))))).........)))))))))....
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DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).....))))))...)))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...)))))))))....
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...((((((((((((.....((((..................))))...)))))).)))))).....)))))))...))))))))....
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....................................((((....(((....)))....))))...........................................
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....................................((((....(((....)))....))))...........................................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...)))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).))).)))))...)))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((((((((((((((.(...((((((((((((..))))))))))))..))))))).))))))).)).))))).))..))))))))....
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.(..................(...(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))........................)......).))
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.....................((((((.....((((....(((....)))....))))...))))))......))..........................
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...)))))))))....
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...)))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...)))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((((((....))..))))...(((((.....))))).......((((.....((((((......)))))).)))).....))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................