|
|
|
AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).)))))))...))))))))....
|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))...)) |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))....... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((..(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))...))).))))))...)))))))).... |
|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................(((....)))................................................... |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((...(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))......)))))...... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((((((((((....)))))))))))........................................... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))..))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((..((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).)...)))))))...)))))))).... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((..(.(((....)))..).))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((...((((..[[[[[[..)))).....(((.....(((....))).....)))...(((((..]]]]]]))))).........))))))))).... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).....))))))...))))))))).... |
|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((.((((((((.((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))).)).))).))).)...))))))).).... |
|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..((((((((((((.((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).))..)))))...))))))))..... |
|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((...((((((...)))))).(((.......)))..)))))).)))))).....)))))))...)))))))).... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((.....(((....))).....)))........................................... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((.(((<<<(.{{{{{(...aaa.)))..(((((((...[[[[.)AAA...)}}}}}>>>)))))))..))))))...)))))))))]]]] |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).)).)))).................. |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).)).)))).................. |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((.....(((....))).....)))........................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...))))))))).... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((.....((((..................))))...)))))).)))))).....)))))))...)))))))).... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))..................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).))).)))))...))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((((((((((((((.(...((((((((((((..))))))))))))..))))))).))))))).)).))))).))..)))))))).... |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(..................(...(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))........................)......).)) |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((.....................((((((.....((((....(((....)))....))))...))))))......)).......................... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
|
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...))))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((((((....))..))))...(((((.....))))).......((((.....((((((......)))))).)))).....)))))))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |