|
|
|
AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU |
Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).)))))))...))))))))....
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))...)) |
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))....... |
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((..(((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))...))).))))))...)))))))).... |
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................(((....)))................................................... |
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((...(((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))))).)).)))))......)))))...... |
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((((((((((....)))))))))))........................................... |
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))..))))))..)).))))))...))))))))).... |
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((..((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).)...)))))))...)))))))).... |
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((..(.(((....)))..).))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((...((((..[[[[[[..)))).....(((.....(((....))).....)))...(((((..]]]]]]))))).........))))))))).... |
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))))).....))))))...))))))))).... |
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((.((((((((.((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).)))).)).))).))).)...))))))).).... |
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..((((((((((((.((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).))..)))))...))))))))..... |
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((...((((((...)))))).(((.......)))..)))))).)))))).....)))))))...)))))))).... |
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((.....(((....))).....)))........................................... |
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
NanoFolder
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((.(((<<<(.{{{{{(...aaa.)))..(((((((...[[[[.)AAA...)}}}}}>>>)))))))..))))))...)))))))))]]]] |
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).)).)))).................. |
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((((((((((..(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))...)))))...)))))).)).)))).................. |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................(((.....(((....))).....)))........................................... |
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...))))))))).... |
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((...((((((((((((.....((((..................))))...)))))).)))))).....)))))))...)))))))).... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................(((.....(((.....(((....))).....)))...)))..................................... |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....................................((((....(((....)))....))))........................................... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).))).)))))...))))))))).... |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((((((((((((((((((.(...((((((((((((..))))))))))))..))))))).))))))).)).))))).))..)))))))).... |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.(..................(...(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))........................)......).)) |
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((.....................((((((.....((((....(((....)))....))))...))))))......)).......................... |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))).).)).))))))...))))))))).... |
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..))).)))))...))))))))).... |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).))))))...))))))))).... |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((....((((((....))..))))...(((((.....))))).......((((.....((((((......)))))).)))).....)))))))).... |
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................... |