RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00339

RNA: SRP_00339
Rfam family: Archaea_SRP

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((..((.(((((((.(((((((.......)))))))...)).)))))......(((((((....))))...........((((((((((((((((((((((....((.((.(((((((..(((((..(((((.((((.(((((((((((((((....))))))))))))))))))).((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).....)))).)..)))))..).)))))).)).))..))))))....)))))))))).)))))).))).....))..))
CMfinder(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((((((((.....)))))))...((((...........)))))))...........(((((.......)))))..............................(..(.....)..)((.((.(((((.(.((((((((....)))))))).).))))).)).))(((......((.....(((....))).....))....)))................................................................................
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.((((((((((.(((((((.......)))))))...))).))))).......)).)).(((.((((((........((((((((((((((((((((.((...((.((.((((.((((((((((((((((.((((.(((((((((((((((....))))))))))))))))))).((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).....)))).))))))))..)))))))).)).))...)).))))..)))))))))).)))))).....))))))))).
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((..........(((((........)))))....((((...........))))))))...(((((((........((((((((((((((((((((((....(((((..(((((((..((((((...)))))).((((((((((((((((....)))))))))))))))).....))))))).((((((....((((..(((((...............)))))....))))...))))))..)))))......))))))....)))))))))).)))))).....)))))))...
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((.((.(((((((.......)))))))...))..))))).................((((((........((((((((((((((((((((((........(.(((((((..(((((..(((((..((.((((((((((((((((....))))))))))))))))))..((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).....)))).)..)))))..).)))))).)......))))))....)))))))))).)))))).....))))))....
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((......)))..(((((.{{{{{..)))))....(((..}}}}}....)))((((....))))((((....)))).(((((.......)))))...(((......aaaaa)))...(((((AAAAA)))))...((((((((((((((....)))))))))))))).((((...........[[[[.))))(((..((((..........))))...(((((..<<<..)))))>>>]..(((((........((((.....))))]]]...))))).........))).....

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