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CCCGGGGCCUAUGCAAAAAAGGUUUUUCGAACCCCGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAGAUUAAUUCUUUUUGUGCCGUAGUGUUCCCGGGUUUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((((((....((.....((((....(((....)))....))))..)).....))))))).))).))))...))))))).... |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................. |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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.........................................(((....)))............................................... |
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CentroidAlifold(seed)
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CentroidAlifold(20)
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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ContextFold
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Contrafold
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Cylofold
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DAFS(20)
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DotKnot
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Fold
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HotKnots
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
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MCFold
(ext)
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MXScarna(seed)
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MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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Mastr(20)
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MaxExpect
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
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Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(seed)
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|
PPfold(20)
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|
Pknots
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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ProbKnot
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RDfolder
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
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RNASampler(20)
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[ FASTA input ] |
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.................................((((....(((....)))....))))....................................... |
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RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.........................(((.....(((.....(((....))).....)))..))).................................. |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................((((....(((....)))....))))....................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((((((..(((..((.....((((....(((....)))....))))..))..)))..))))))...))))).)).)))))).... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAwolf
(ext)
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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............................................................((................................)).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((..(((((...........((((....(((....)))....))))..........)))))..))).)))).).))))))).... |
|
UNAFold
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[ FASTA input ] |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.........)))).(((((..............))))).......(((((.((..........))..)))))......)))))).... |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.........))))......(((...........(((((((((...[[[[[[......)))))))))]]]]]]...))))))))).... |
