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UUAUAAUAUAUAUGUCAUUACAAUAUUAAGUAGCGAACCUUGUCAGGCCAGAGAUGGAGCAGCAAUAGCAAUAUCUUUUUAUGUGUGAUGACAUAUAUUAA |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................... |
|
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
|
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((((((..(((...........((....(((....)))....))...........)))..))).)))))))))))))))... |
|
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((((((((((((...............(((....)))..(((((((...............))))))).....)))))))))))))))... |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........((((((((((((...............................................................))))))))))))..... |
|
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).))))))............ |
|
PETfold_2.0(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))....)))))).))))))............ |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
|
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((((((..(((..((...(((....)))(((....))).)).((....)).....)))..))).)))))))))))))))... |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((((((((((((....((((........)))).......(((((((...............))))))).....)))))))))))))))... |
|
RNASampler(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............((((...............................(((....)))................................))))........ |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...............................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................((((....(((....)))....)))).................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((((((..(((..((...((.(.((......)).).)).)).((....)).....)))..))).)))))))))))))))... |
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RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((((((((((((((...............(((....)))..(((((((..((.......))..))))))).....)))))))))))))))... |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((((((..(((..((...(((....)))(((....))).)).((....)).....)))..))).)))))))))))))))... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............................(((.....(...(............((......))...........)........)........)..))... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........................................................................(.(..............).)...... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((((((((((((..(((.........((((....(((....)))....)))).........)))..))).)))))))))))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((.....))).....(((........))).........(((........))).(((...............)))..(((((((....))))))).... |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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