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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00358



RNA: SRP_00358
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((.((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................(((.....((((....(((....)))....))))..)))............................................
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.((((((((((......(((.....((((....(((....)))....))))..))).......))).))).))))...))))))))))))).........
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................(((....))).........................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...))))).................
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................(((((((((((....))))))))))).................................................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).))))))))))))).........
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).))))))))).............
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((.(((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).))))))))))))).........
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...((((...........)))).((((((....(((....)))......(((((........))))).))))))....))))))))))))).........
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(.(((.....(.............(......((((....(((....)))....))))...)................).......))).)................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((..((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..)))......))))....)))))...))))))))))))).........
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...))))))))))))).........
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).)))..)))))))).........
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...))))))))))))).........
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..)))))))))))).))))))))))))))))))))))).).))))))))))))).........
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(.....((((((.(((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).)).)))))...))))))..).............
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((.....((((((((((((((((((...(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))....)))).))).)))).).)))))).....)).........
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .................................................................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((((((((((((((...(.(((.....((((....(((....)))....))))..))).)....)))).)).))))).).))))))))..............
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...))))))))))))).........
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...((((...........)))).(((((((((((((((..........)))........))))))...))))))....))))))))))))).........
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............(((((((...........................................................)).))))).........................
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................(((.....(((....))).....))).................................................
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((...((((.......aaa.)))).((((((((((((..<<<<<.AAA.((.{{([[[[)))))))))}}))))))]]]]))))))))))))).>>>>>...
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))..........................
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................((((....(((....)))....)))).................................................
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...............((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))..........................
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................((((....(((....)))....)))).................................................
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................(((.....(((....))).....))).................................................
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).))).))))...)))..)))))))).........
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((((((.....((([...(((((....(((....)))....))))]))))......)))).)).)))))...))))))))))))).........
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((..((((............((((......))))...........((((...))))..))))....)))))...))))))))))))).........
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................((((....(((....)))....)))).................................................
RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))............................................
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ......................................(((.....(((....))).....))).................................................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).)))..)))))))).........
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...))))))))))))).........
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).))).)))).).)))..)))))))).........
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((((((((((((...).((((((((((((((..)))))))))))).)).).)))).)))).)).))))).).))))))))))))).(......)
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...........................(.((((.....((((....(((....)))....))))..)))....).................................).....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.........(((...(((..((((.....(((.....((((....(((....)))....))))..)))......))))....))).....)))...)...............
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((((((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).))))).).)))..)))))))).........
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...))))))))))))..........
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((.(((((((((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))).)).)))))...)))..)))))))).........
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((....))))..((((...........))))...(((......))).((((.......((((.((.......))))))..(((((.........)))))..))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((....))))).((((...........))))..(((..[[[[[.)))........((((((........)))))......{{{{{)]]]]]...}}}}}..........