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UUCCAGCAUACAGCAAUAUUUUUAUUAGUAAAUUCGAUCAGGUCCGACAGGAAGCAAUCGUAGCUACAAAAAGUAUGUGUAUAGUAUGCUGGAAAAUU |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Cylofold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
|
MCFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.(((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..))))))).))).).)))).)))))).... |
|
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................. |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
|
McQFold
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((....((((((((...........((((....(((....)))....))))........)))))))).......))))))))))).... |
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PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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Pknots
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[ FASTA input ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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|
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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|
RDfolder
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((......((((........))))(((........)))....................................))))))))))).... |
|
RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((....((((((((..((((.....((((..................))))..))))..)))))))).......))))))))))).... |
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RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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..........................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))................................. |
|
RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
|
RNAshapes
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
|
RNAsubopt
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
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UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((.(((((((((((..((((.....((((....(((....)))....))))..))))..)))))))).)))...))))))))))).... |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((...((((....))))........((((..................))))....((((.........))))..))))))))))..... |
