RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - SRP_00367

RNA: SRP_00367
Rfam family: Bacteria_small_SRP

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((.((((((((((.((((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...)))))...)))))))))).)))).........
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).)))))...))))))))))........)))).)
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((.............)))))..............(((....))).((..((((....))))..))......................................
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).))))...))))))))))...)))))......
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....................................................................................................................
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CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................(((((.(((((....))))).)))))...................................................
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.((((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...)))))...)))))))))).)))).........
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.((((.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).)))..)).)))))...)))))))))).)))).........
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((((........((((((....[[[[[....(((....)))..........))))))...]]]]]...)))))...))))))))))...)))))......
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).)))))...)))))))))).)))).........
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).)))))...)))))))))).)))).........
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MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))..))))))))))))))((((((((((..))).))))))))))(((((.((...)))))))(((..)))...))))).
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))............................
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................((((....(((....)))....))))...................................................
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).))))...)))))))))).)))).........
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((.(((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))..))))..)).)))))...)))))))))).)))).........
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RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((.................................(((....)))...................................))))....................
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RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).)))))...)))))))))).)))).........
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).))))...)))))))))).)))).........
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((((((((((((((((((.....(((.((((((((..)))))))).)))..)))))))).)))).)).)))))...))))))))))))))).........
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((......................................((.(...((......(........((......((.....))...))....)...))...).))........))....
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................((..(...........(..............((....))..............)......)..))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.((((.((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))..))))...)))))))))).)))).........
TurboFold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).))))...)))))))))).)))).........
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).))))...)))))))))).)))).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((.(((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).)))))...)))))))))).)))).........
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........(((((........))))).............(((((....((((...........))))(((....)))))))).((((........))))((((......))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.....((((((..[[[[.......)))))).....)))))...((((...........))))(((....)))]]]]..((((........))))((((......))))....

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