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GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC |
Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))...)).)))....))))))))))))))) |
Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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CentroidAlifold(20)
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CentroidFold
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(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(..(((.....(((....))).....)))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
CentroidHomfold‑LAST
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ContextFold
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Contrafold
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Cylofold
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DAFS(20)
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DotKnot
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Fold
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HotKnots
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IPknot
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MCFold
(ext)
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MXScarna(seed)
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MXScarna(20)
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Mastr(seed)
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............................................................................................................ |
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
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MaxExpect
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[ FASTA input ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
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...((((((((((((..............................................................................))))))))))))... |
Murlet(20)
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........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
PETfold_2.0(seed)
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PETfold_2.0(20)
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PETfold_pre2.0(seed)
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PETfold_pre2.0(20)
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PPfold(20)
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[ FASTA input ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
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...........((((.................................(((....)))...................................))))........... |
RNAalifold(seed)
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[ FASTA input ] |
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RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((..(((((..((((((.(((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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((((((((..(((((..((((((.(((..((((((..(((((....))(((....)))......))).))))))...)))..))).)))....)))))..)))))))) |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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.((((((((((((((..((((((.(((((((((((.....(((.((((((((..)))))))).)))..)))))))).)).).)).))))....))))))))))))).) |
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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Sfold
|
[ FASTA input ] |
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TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).)))....))))))))))))))) |
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
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((((((((..(((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((......))).(((.............)))......(((((((...((((...[[[.[[..)))).((((((.......]]]]]..))))))..)))))))..... |