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GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC |
| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...))))....)))))))))))))))
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((((((..((((((.(((..((((((..(((........(((....)))......))).))))))...)))..)).))))....))))))))....... |
|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))...)).)))....))))))))))))))) |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................(((....))).................................................. |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..........(((((.(((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))..)))))).)).)))))...))))).......... |
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CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(..(((.....(((....))).....)))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..(((((..(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...))).)...))))....))))))))))))))) |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(..(((.....(((....))).....)))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
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Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((........................(((((....(((....))).....[[[[(.{{{{{...))))))]]]].}}}}}))))))))))))))) |
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DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
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(((((((((((((((..((((...(((..((((((..(((........(((....)))......))).))))))...))).....))))....))))))))))))))) |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
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HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..((..((.....(((....))).....)))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
|
MCFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..))))))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))) |
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MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((.......((((((((((((((((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)))))).))).))))..)))))))...)).... |
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MXScarna(20)
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|
Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................ |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
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...............................(((......((((....(((....)))....))))...))).................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(((.(....).(((....)))......))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((..................(((((....((((...........))))..........)))))...))))....))))))))))))))) |
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Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((((((((((..............................................................................))))))))))))... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))................... |
|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................((((....(((....)))....)))).......................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.................((((((((((((.(((((.....(((.(.(.(((....)))..).))))..)))))..)))))).)).))))................... |
|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................((((....(((....)))....)))).......................................... |
|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(((........(((....)))......))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..............((((......(((((....((((...........))))..........)))))......)))).))))))))))))))) |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...........((((.................................(((....)))...................................))))........... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................(((.....(((.....(((....))).....)))..)))..................................... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................(((.....(((....))).....))).......................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..((((((.(((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((..(((..((....(((....))).))...))).))))))...)))..)).))))....))))))))))))))) |
|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..((((((.(((..((((((..(((((....))(((....)))......))).))))))...)))..))).)))....)))))..)))))))) |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((((((..((((((.(((((((((((.....(((.((((((((..)))))))).)))..)))))))).)).).)).))))....))))))))))))).) |
|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(..............................(((.....((((.....(((....))).....)))....)..............)..........)).....).... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
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............(.(.(((((((...((..((((......(((.(...(((....))).)...)))...))))......)).))).)))........).)....)... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..(((.((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))..)))....)))))..)))))))) |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..))).)))....))))))))))))))) |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((..(((((..((((((.(((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))..)).))))....)))))..)))))))) |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((((.(((.((....................)).))).(((...........)))....((((...((....))...)))).))))))))))))))) |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((......))).(((.............)))......(((((((...((((...[[[.[[..)))).((((((.......]]]]]..))))))..)))))))..... |