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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00061



RNA: TMR_00061
Rfam family: tmRNA

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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((((((..........)))))).(((((.((((.((((((.......((((...(.......)))))....((((((((....)))))))).....((.(((((()))))).))((((((((((.(((((.....)))))...)).))))))))..........)))))).))((((((.....))))))..(((((((((........(..(((..((((((.(((.(((((....))))).))).))))))..)))....)......))))))))).)).)))))...................(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((.......((((....))))..))))).))).((((.(((((((..(((((((..(((.((((((...(((((((....)))))))(..(((((.((((....)))).))((((((((((.(((((.....)))))...)).)))))))).....)))..)...(((((((((((.....))))))..(((((((((...(((.((..(((..((((((.(((.((((......)))).))).))))))..)))....)).))).))))))))).))))).....))))))..)))...))))))).))))..)))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((..(.((((.............))((...)).))).)))(((((.((.((.(((((((((((((((.((((((..((((((........)))))...(..)(.(((((..))))).).((((((((.((((((((...))))))...)).)))))))).........(((((((.((..(((((((((((((.((.((..))((((..)))))).)))))))))))))...(..).((((..))))))))))))(((........).))...((((..)..)))...)..)..))))).).))))).))))))))))))...))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((......(((((.......((((....))))..)))))......(((.(((...((((((((((..(((.((((((...(((((((....)))))))...((....((((....))))...((((((((((..((..((....)).))..)).))))))))......))......(((((((((((.....))))))..(((((((((...(((.((..(((..((((((.(((.((((......)))).))).))))))..)))....)).))).))))))))).))))).....))))))..)))...))))))).)))..))).))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((......(((((.......((((....))))..))))).....((((.(((((((..(((((((..(((.((((((...(((((((....)))))))...((((..((((....))))...((((((((((..(((.((....)))))..)).))))))))....))))......(((((((((((.....))))))..(((((((((...(((.((..(((..((((((.(((.((..(....)..)).))).))))))..)))....)).))).))))))))).))))).....))))))..)))...))))))).))))..)))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((......)))))..((((.(((((...........)))))......(((.....((((............)))).....(((((((....))))))).....))).((((....))))..)))).(((.((....))))).((((....)))).(((.......)))..((((.(((....))))))).(((((.(((....)))(((.......))).))))).(((.....))).......(((((.....((((................................)))).(((((.......))))).((((((........))))))..)))))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((....[[[[[.))))..(((((]]]]]......)))))..(((((.{{{{{....))))).((((..}}}}}..)))).(((((....))))).((((......((((....))))..((((((((.((....))))).((((....))))......((((......((((.(((....))))))).(((((((((....))))........<<<))))).(((((.>>>.))))).((((..((....))..)))).............)))).(((..........))).))))).......))))..((((((........))))))..)))....