RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00117

RNA: TMR_00117
Rfam family: tmRNA

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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((.(((.....................................................(((.((((....)))).))).(((((((...(((((((....)))))))...)))))))..................................................((((..(((.....)))))))..........(..........................)...................(((((.....................)))))........................)))....)))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((((((((.............(.(((((((..(...)..))))))).)..........((((.((((....)))).))))(((((((..((((((((....))))))))..))))))).(((((.((((.(((.......)))....))))..)))))..........(((((((.((.......)).)))))..))((((((..((((........))))..))))))...............((((((((..((..........))...))))))))..((((..........)))))))))...))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((((((((...(((((.((((((((....((......).)))))))))..........((((.((((....)))).))))(((((((..((((((((....))))))))..)))))))((((((.((((((((.......))))...))))..)))))).........((((..((((...)))))))).....................(((((..........)))))........(((((.((((((((.(((.(......).)))..))))))))..)))))........))))))))))...))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((.......(((((((((((....((((((...[[[[[[[[.))))))........]]]]]]]]..........((((.((((....)))).))))(((((((..((((((((....))))))))..)))))))((((((.((((((((.......))))...))))..)))))).........((((..((((...))))))))........((((((..((((..[[[[[.))))..)))))).......]]]]]...((((((((.(((...[[[[[[[)))..)))))))).........]]]]]]]...........)))))))))))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((((...((((((....((.((.((((((((......).))))))).))..........(((.((((....)))).))).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))((((((.((((((((.......))))...))))..))))))((.((.((.((((..((((...)))))))).)))).)).(((((..((((........))))..)))))))....))))))(((.((((((((.(((..........)))..))))))))..)))....((((((.....)))))).)))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((((.....((((((.(((.((.((((((((......)).)))))).)).........((((.((((....)))).)))).((((((..((((((((....))))))))..)))))).((((((.((((((((.......))))...))))..))))))...........))).)))))).(((((..(((((..((.(((((..((((........))))..))))))).....((..((((.((((((((.(((.((....)).)))..))))))))..))))..)).)))))...)))))...)))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(.(.(.(...)(((((...(((((.((((((((((((((((.(((((((......((..)).((((((...((.((((.......)))).))(((.(((....))).)))..((((((((.((((((((....))))))))).)))))))(((((((((((((.............))).)))).))))))....((...((((..((((...))))))))...))(((.............).)).((..))))))))..((..))(((...))).(((((((((((((((..)))))))).))))))))))))))......((..))).)))))).)..)))))))).)))))..))))).)))(((((...)..)))).)))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((..(((..(((((((((((.....((((((.(((..(.((((((.(......)..)))))).)..........((((.((((....)))).)))).((((((..((((((((....))))))))..)))))).((((((.((((((((.......))))...))))..))))))...........))).)))))).((((((.(((((..((.(((((..((((........))))..))))))).....((..((((.((((((((.(((.((....)).)))..))))))))..))))..)).))))).).)))))...)))))))))))..))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((..((..(((..(((..((((((.....(((((..(((.((.((((((((......).))))))).)).........((((.((((....)))).)))).((((((..((((((((....))))))))..)))))).((((((.((((((((.......))))...))))..))))))...........)))..))))).(((((..(((((..((.(((((..((((........))))..))))))).....((..((((.((((((((.(((..((....)))))..))))))))..))))..)).)))))...)))))...))))))..)))..))).))..)))...(((((.......))))))))))))....
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................

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