RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00128

RNA: TMR_00128
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.((((((((((((((.......))))))))..(((((((.(((((((((.((((((............)))))))))....((((...((....))...)))).)))))))))))))..(((((((.(((((..(((((((........)))))))...)))))((..(((((..((....((((((..((((((((.((((...((((.............((((........)))).(((....))).))))...))))))))))))..))))))...))..)))))..)).)))))))........))))))((((((((.......))))).))).)).)).
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((...........(...((((...............................................((.............))...((((((......))))))(((((..(((((((........)))))))...))))).................................................................(((((.(((........))).)))))..............................))))......)...........))))))))...(((((.......))))))))))))....
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((...[[[[[[[[[)))....]]]]]]]]].(((((((.(((((((...((((((............)))))).......((((..............))))))))))))))))))..(((((((.(((((.((((((((.[[[[[[.))))))))..))))).......]]]]]]..((((((((((....[[[[[[)))))))))).....]]]]]].((((...[[[[[[.[[[.))))...]]].]]]]]]...........(((((.......)))))..........))))))).............(((.[[[[[)))....]]]]]...........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((((((....).))))))))).(((((((.(((((((.........(((.(((......((((....))))......)))..)))........))))))))))))))..((.((((.(((((.((((((((........))))))))..))))).......)))).)).((((((((((..........))))))))))...........((.(((..((((((.(((........))).))))))..))).))....((((.......)))).((((....)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....(((((..{{{{{{{{{)))))...(((((((.(((((((...((((((............)))))).............................))))))))))))))...((((((.(((((.((((((((..[[[...))))))))..))))).....((((]]]...((((<<((((aaaaaaaa..))))..))))...................((((((.(((........))).)))))).....AAAAAAAA(((.>>....)))..))))......))))))......}}}}}}}}}...(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((((((....)).)))))))).(((((((.(((((((....((...((.............................))...)).........))))))))))))))..((.((((.(((((.((((((((........))))))))..))))).......)))).)).((((((((((..........))))))))))...........((.(((..((((((.(((........))).))))))..))).))....((((.......)))).((((....)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.(...))))))..(((((.......(((..)))((((((((((.((((..(((((((((.(((.(((((((((((......)))))).))).(((.....)))..((((((((...)))))))).(((((((((((((((....)..))))))))).)))))((((((((((.....((((((.((((.(......)))))))))))((........)))))))))(((((((((((......)))))))))))....))).)).))))))))))))..))).).)).))))))))(((((.....))))).((((((((((...)..))))).)))))))).)
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..(((((........(((((((.(((((((....((((.((.............................)).)))).........))))))))))))))...((((((.(((((.((((((((........))))))))..)))))((..(((((..((....((((((..((((((((..(((....(((.............((((........))))............)))....))).))))))))..))))))...))..)))))..)).))))))......)))))..))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((..((((........(((((((.(((((((....((((.((............((....)).........)).)))).........))))))))))))))..(((((((.(((((.((((((((........))))))))..)))))....(((((..((....((((((...(((((((..((..(..........)..))....(((..((((((.(((........))).))))))..))))))))))...))))))...))..))))).....))))))).....))))..)))...(((((.......))))))))))))....
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((..........((((((((((........)))).((.dddd..))..[[[[[[.)))))).....]]]]]].............)))).DDDD........((((.((((((......)))))).((((.(((((((..aaaaaa..)))))))..))))........AAAAAA..((((((((((...{{{{{{{)))))))))).....}}}}}}}.((((..cccc..)))).(((.<<<)))(((>>>C..)))CCC....((((..bbbbb)))).((((....)))).(((((.......))))).....((((..BBBBB)))))))).)))....

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