RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00135

RNA: TMR_00135
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((((....((((((((...))))))))..((((((((((..(((((...)))))(((((.....................)))))...))))....)))))).((((((((....)).))))))(((((((((((((..........)))))).)))))))..)))))..(((((..((((((((....((((((((((..........))))..)))))).((...((((((..((........))..))))))...))...((((..(((((((((((((........))).....))))..))))))..))))))))))))..))))).)))))))....
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((((.((.(((((((((...(((((..............................................((.((.......)).))...((((((.........))))))(((((((((((((..........)))))).)))))))................(...((((((..........))))))...)....................((((((.(((........))).))))))..........................)))))......))))))))).))))))))))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..............(((((((.(((.(((((((((.(.(((((...(((........))).............................((((((((.....))))...((((((.........))))))(((((((((((((.((...))..)))))).)))))))......(((......(((..((((((..........))))))..)))..........))).((...(((((..(((........)))..)))))...)).................)))))))))....).))))))))).))))))))))...(((((.......))))).))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......(..((..(((((((.(((.(((((((((.(.(((((...(((((((.))))))(((((.....................)))))((((((.....)))))).(((((((((()))).))))))(((((((((((((..((....)))))))).)))))))......((((((...(((..(((((((((())))..))))))..)))..)))).....)).((...((((((.(((.(.....)))).))))))...)).................)...)))))....).))))))))).)))))))))))))(((((.......))))))))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......(((((..((((((((...)))))))).))))).......(((.[[[[[[.)))...........]]]]]]..............((((((.....)))))).((((((.........))))))(((((((((((((..[[[[[[..)))))).))))))).......]]]]]]..(((..((((((..[[[[[[..))))))..))).......]]]]]]......((((((.(((.[[[[[[[))).))))))................]]]]]]].(((........)))..(((((...(((...[[[[[)))...]]]]]..))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......(((((..((((((((...)))))))).)))))..(((.(((...))).)))..(((((.....................))))).(((((.....)))))..((((((((....)).))))))(((((((((((((..........)))))).))))))).........((((((.((((((((....((((((((((..........))))..)))))).((...((((((.(((........))).))))))...))....(((..((((((....((.(((.(((...))).)))))...))))))..))).)))))))).)))))).)))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((.((((((..((((.((...))))))..))))))..((((..(((.((..)))))((((((.(((((......))))).))).)))))))....))))))))))(((((((((..))).))))))...((..(((((.(..((((((.((((...)))).........))))))..)))))).(((((..........))))).(((..))).....((...))..))((((((((((........))))))))))(((((((.(((((((((((((.((((((((..)))))..)))...))))..))))).))))(((((...)..)))))).)))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((..(((..((.(((((((((..(((.(((.((.....)).))).))).........(((((................(((((.....)))))...((((((......).))))).(((((((((((((.(.....)..)))))).)))))))...............(((..((((((..........))))))..)))..............((...((((((.(((........))).))))))...))......................))))).....))))))))).)).)))..))....((((.......)))).)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((..(((.(((..((((((((..(((.(((.(((...))).))).))).........(((((...............((((((.....)))))).((((((((....)).))))))(((((((((((((.(.....)..)))))).))))))).......(..(....(((..((((((..........))))))..)))..(((.(((.....((...((((((.(((........))).))))))...)).....))).))).....)..).))))).....))))))))..))))))..))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((.....(((((....))))).(((.((((((....)).))))....((((.....))))..........)))..............)))).(((((.....)))))..((((((((....)).)))))).((((((((((((..........)))))).))))))........((((((.......))))))..((((((((((..........))))..)))))).......(((((................))))).(((((....(((....((((...............))))..((((......))))..))).((((.......))))...)))))....
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