RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00140

RNA: TMR_00140
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....((((....((((((.((((..(((((((......(((((((..(((((..((((..............(((((.((............)).(((....)))...))))).((((..(((((((.......)))))))...))))))))...))))).......((((((((((((((((((((((.(((....(((((....)))))))))))))....))))..))))((((...(((((((((.........)))))..)))).....)))).))))))))))))).)))....(((..(((((...)))))..)))....)))))))..))))))))))))))((((.......)))).)))))))....
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((........(((((((((.........................................((((.(((....))).))))(((.((((..((((((.........))))))...)))))))((((((.((((((.........))))))...))))))................((((((((((..........))))))))))...............((.(((((....(((((.((........))..)))))))))).))..................)))))).))).....)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((....)))((((((.......(((((((......((((((...(((((((((((...((((.......))))..(((.........((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))))))............))))))))))).....))))))........((((....((((((((((..........))))))))))...)))).(((...(((.(((((....(((((...............)))))))))).)))..........(((((...))))).))).....)))))))......))))))...(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((.((.((((((((((((((((((((((....((.((((.((......))..........((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...)))))))........)))).))))))))))))).))).)))))).)).))..((((....((((((((((.((....)).))))))))))...)))).......(((.(((((....(((((.((........))..)))))))))).))).....(((..((((.....))))..)))....)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((.....(((((((((((((((((((((................................((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...)))))))...............))))))))))).))).)))))))...............((((((((((..........))))))))))..............(((.(((((....(((((...............)))))))))).))).....(((..((((.....))))..)))....)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((....((((((((((((((((((((((....((.(((..((......))..........((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))).........))).))))))))))))).))).)))))).)).....((((....((((((((((.((....)).))))))))))...)))).......(((.(((((....(((((.(..........)..)))))))))).))).....(((..((((.....))))..)))....)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((....((((((((((((((((((((((....((.((((.((..................((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))).....)).)))).))))))))))))).))).)))))).)).............((((((((((.((....)).))))))))))....(((.(((...(((.(((((....(((((.((........))..)))))))))).)))..........((((.....)))).))).))).)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((([[[.)))((((((.((((..(((((((....((((((((((((((((((((((.......((((.....................((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...)))))))........))))...))))))))))).))).)))))).)).....((((.((.((((((((((..........)))))))))))).)))).....(.(((.(((((....(((((...............)))))))))).))))....(((..(((((...)))))..)))....)))))))..))))))))))]]](((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((......))))))...((.((((...((........))((((.((((((((......).).)))))(..)..)))))...((((((.((((((((.((((((((...(((((((.(((....(.(((((.(......))))))).))))))).)))((......))..)))))))))))))))).(((((.(((......)))...)))))))))).).((((((((((((((((((((((((((((..((.(((((((..((.(((((((((((((((.(........)((((......).)))(..).)))))).)))))))))))))))).)).))))))).).))).))).))))).)).))))))))).))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.((((..(((((((....((((((((((((((((((((((....((.((((.((..................((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))).....)).)))).))))))))))))).))).)))))).)).............(..(((((((.((....)).)))))))..)........(((...(((.(((((....(((((...............)))))))))).)))..........(((((...))))).))).....)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((((.(((...(((((((........((((((((((((((((((....((.((((.((..................((((.(((....))).))))(((.((((..(((((((.......)))))))...))))))).....)).)))).)))))))))))...(((..(((.(((......((((.((.(..((((((..((....))..))))))..))).)))).......(((.(((((....(((((.((........))..)))))))))).)))...))))))..)))...)))))).))).....)))))))...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((......))))))..((((((((((...............)))).((((.....[[[[[..))))..]]]]]...<<<<<.<<..........))))))..........>>>>>>>...((((..(((((.......))))).(((.....(((((...{{{)))))..((((((}}}...(((.....)))......)))))).....)))..(((.....))).))))....((((.....(((.(((((.aaaaa)))))..bbbbAAA.....AA)))..BBBB...............)))).((((.....))))..((((....((((.((......))))))..(((((.......)))))...))))....

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