RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00143

RNA: TMR_00143
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((.(((((((..((...........))..)))))))))))............(((((((((.(((...(((....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((........))))))...))))))...((((((...(((((..(((((((((((...)))).))))).))..........))))).(((((((((...(((........)))..))))))))).............)))))).))).((..........)).))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.........................................(.................)........................((((((..........))))))..................................................................................................................................(...........((........))..........)......................................................(((((.......))))))))))))....
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((........[[[..))))....]]]...........(((((.[[[[[...)))))............]]]]]....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((.[[[[[[[))))))...))))))........]]]]]]]..(((.(((((((((...)))).))))).)))...........(((.((((((((((.(((.........))).))))))))))[[[[[[[[....(((((((......)))))))...)))..]]]]]]]].....(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((.((((.(((((((..((.((.....)).))..)))))))))))))..........(((((((((.(((.((((.....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((........))))))...))))))............((((((((.(((((((((...)))).))))).))).........))))).((((((((((..(((........))).))))))))))............(((((((......)))))))..)))).))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((.((((((((...................)))))))))))............(((((((((.(((..........((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((........))))))...))))))....((((....((((((((.(((((((((...)))).))))).))).........))))).((((((((((.(((.........))).))))))))))............[[))))............]].......))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((.((((.(((((((..((.((.....)).))..)))))))))))))..........(((((((((.(((.((((.....((((((((((........))))))))))...((((((((.......)))))))).((((((..((((((........))))))...))))))............((((((((.(((((((((...)))).))))).))).........))))).((((((((((..(((........))).))))))))))............(((((((......)))))))..)))).))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..((((...[[[[[[[...))))....(((..........((((((.........)))))).............(((....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((........))))))...)))))).....)))....(((((....(((((((((...)))).))))).............))))).((((((((((.......]]]]]]]...))))))))))((((((((....(((((((......)))))))........)))))))))))..(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(.......).((.(((((.((.((((((((.(((..))..((((.......).))).(((((((.(((((((((((..........))))).).(((......)))...((((((((((....).)))))))))(((((((.(((((..........))))).).))))))((...(((...(((((..(..(((((((((...)))).)))))))))))..(......).((((((((((((.(((((((..))))))))))))))))).))(((......)))...((......)))))....)).)))))))))))).)))))))))))))))))).)))))))....
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UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((.((((.(((((((..((..(.....)..))..)))))))))))))..........((((((((.((((...(((....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))((((((..((((((........))))))...))))))...((((((...((((((((.(((((((((...)))).))))).))).........))))).((((((((((..(((........))).)))))))))).............)))))).))).(..((....))..).))))))))))))..(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.....((((.(((((((...................))))))))))).(((((...((.........))....)))))....((((((((((........))))))))))..(((((((((.......)))))))))..((((..((((((........))))))...)))).(((((.((..................)))))))...(((((....))))).............((((..........)))).(((((...((((........))))...((((..((.......))..))))..)))))..............(((((.......))))).))))))....
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