RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00146

RNA: TMR_00146
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.(((((((((.((((.......)))).((((...(((((((....(((((........((((..((((((.(((((..(((((((........))))))).....)).)))))))))))))......)))))..)))).)))..)))).)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......))))).......(((.((..........................................(((....(((..((((....)))).)))...........)))...........))..))).......))))))).......))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((...................................................................................................................................................................................................))))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((.((.((((((((....((((((......(((((...........)))))...............(((((((.((.........((((.((((...(((.....(((..........)))....)))...)))).))))......)))))).))).......))))))..........))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))..(...((((((((.((((((((.............(((((.......)))))...((....(((..((((....)))).)))..))..))))))))..........)))).))))..)...))))))).......))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((........((((((((...((((((((((((.......)))))......((((((((.(((((((((((.......)))..(((((.((((...(((((((........))))))).......)))))))))))))))))..........)))).))))......))))))).........))))))))......))))...(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))..........((((.....(((((((...........((((((.(((((..(((((((........))))))).....).))))))))))...........)))))))....))))......)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.[[[[[.))))).....]]]]]......((((((..............(((((.......))))).........(((..((((....)))).))).......))))))..........................)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))......((((((((......(((((............(((((.((((((..(((((((........))))))).....).))))))))))............))))))))).))))......)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.........................((((((((...((((((((((((.......)))))...............((((((((...................((((((...(((((((........))))))).......))))))...)))))))).........................))))))).........)))))))).............(((((.......))))))))))))....
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(...(..(..((((((((.......((((.(((.((((((.(...(((((.............)))))..........(...............................................(((((((..............)))))))......................).))))))).......))).)))).....)))))))))))((((((...)..))))))))).)).)..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))..........((((.....(((((((...........((((.(((((((..(((((((........))))))).....)).)))))))))...........)))))))....))))......)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.(....))))))(.(((.((((((((.((((.[[[[[[...........(((((.((((((.((((((((........))))))).)...).))))))))))...))))....]]]]]])))).)))).)))).)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((...(((((((......(((((...........))))).....((((((((.......((((...))))...((((...(((((((........)))))))..))))..........)))))))).........................))))))).........))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))..........((((.....(((((((...........((((.(((((((..(((((((........))))))).....)).)))))))))...........)))))))....))))......)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((..)))..((.....................))((((((((((((...))))))).((((.(((((....(((((((((((.(((...((((((((((..)).))))))))((..))(((.((((((..)))))))))))))))))))))))..............))))).))))).))))(((...))).(((((........)))).)...((((((.....)))))))))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((.(((((((((((.......)))))......(((((((...(((((.................(((...(((.(..(((((((........))))))).....)..)))..)))..)))))............))).))))......))))))........))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((((..((((..((((((((.((((((((((((((.......)))))..........((((.....(((((((...........((((((.(((((..(((((((........))))))).....).))))))))))...........)))))))....))))......)))))).......)))))))))))))))..))))...(((((.......))))))))))))....
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.(((((.....)))))..))))....((((...((((...(((((.{{{{{.))))).....}}}}}..............))))..(((.....)))....))))...((((((........)))))).((([[[[..)))...]]]]....(((.....)))......((((((.....<<<<))))))..((((....>>>>......)))).(((((.......))))).))))))....

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