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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00150



RNA: TMR_00150
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((...(((((((((((...((((((..(((((..(((((.............)))))...............((((..((((...((((.......))))(((((((....)))))))...(((((....)))))((((..((((.......))))..))))..))))..))))..)))))((((.............))))...))))))..)))))))..))))..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..(((((((((((((..(((((((((..............))).......................(((((..............)))))........(((((((....))))))).......................(((((.....))))).................................................)))))).)))))..)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((............................................................................................................................................................................................................................................))))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((...((((((((.......((((((...((((..(((((.............)))))...............((((..((((....(((.......))).(((((((....))))))).......................(((((.....)))))........))))..))))..)))).((((.............))))...))))))........))))))))..))))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(..((..(((((((((..(((((((((((((..((((((.(((.....(((((.............))))).))).......((((((((......)))..))))).....((.(((((((....))))))).)).(((......))).((((..(((((.....)))))..))))...........................................)))))).)))))..)))))))).))))))))))))(((((.......))))))))))))....
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IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..((((((((((((((([[[[[[............................................(((((((......)))..)))).........(((((((....))))))).......................(((((.....)))))...........................)))...................]]]]]]..))))..)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..(((((((((((((..((((((.((((....(((((.............))))))))).......((((((((......)))..)))))........(((((((....)))))))...(((((....)))))((((..(((((.....)))))..))))(((((((((((...........)))))))).))).........)))))).)))))..)))))))).)))))))))...((((((....).))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..((((((((.......((((((..(((((..(((((.............)))))...............((((..((((...((((.......))))(((((((....))))))).......................(((((.....)))))........))))..))))..)))))((((.............))))...))))))........)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..(((((((((((((..((((((.((((....(((((.............)))))))))...........((...........((((.......))))(((((((....))))))).........((((((((((....(((((.....)))))................((.......))....))))))))))...))...)))))).)))))..)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........((.(((((((((...((((((((((((..((((((.(((..(((((((......)))...))))..))).............((..........................(((((((....))))))).........((((((((((....(((((.....)))))................((.......))....))))))))))...))...)))))).)))))..)))))))..)))))))))..))((((.......)))).)))))))....
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..(((((((((((((..((((((.((((....(((((.............)))))))))...........((......((((.((((.......))))(((((((....))))))))))).....((((((((((....(((((.....)))))................((.......))....))))))))))...))...)))))).)))))..)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((........))(((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((......))))))))).(((.(((((...(((.(((...........))).)))...))))))))....(((((((....)))))))(.(((......))).).(((((((((((.....)))))))))))..((..)))))))))(...((((..(.......)..)))).((((..))))).))).))))))))))))))))))...(((((.((..))))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..((((((((.......((((((...........................................................................(((((((....))))))).......................(((((.....))))).................................................))))))........)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((((..(((((((((((((..((((((..(((((..(((((.............)))))...............((((..((((...((((.......))))(((((((....))))))).................((((..(((((.....)))))..))))..))))..))))..)))))((((.............))))...)))))).)))))..)))))))).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((.....))).(((((((............))).(((.....))).))))......(((((.............)))))...............((((......))))(((.......))).(((((((....)))))))...(((((....)))))......(((((.....)))))..........(((((((...........)))))))........((((.....((((......))))..................(((((.......))))).))))......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((..............))))).....((((.....)))).((((.....[[[[[..)))).((((..]]]]].......)))).((((..((.......)).))))....((((.(((((((....)))))))..(((....((((.....)))).(((((.....)))))...)))....((((..((((((...{{{{.))))))......}}}}......((((......)))).....))))...))))..(((((.......))))))))))))....