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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00156



RNA: TMR_00156
Rfam family: tmRNA

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..............................(((((.....((((((.......))))))........)))))..((((.....))))..............(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))..........(((((.((((.(((....((((((.(((...)))........)))))).....))).)))).)))))(((((((..........................)))))))(((....)))..........................(((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((..((...((((.(((..(((((.....(((((((.............)))))))..((((.....))))..............(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))...........((((.((((.(((....((((((..................)))))).....))).)))).)))).(((((((..........................)))))))...))))).....)))))))....)).))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((..((...(((..(((((..(((((((((.......))))))...)))..)))))..((((.....))))........(.....(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))..........(((((.((((.((((...((((((.(((...)))........))))))...).))).)))).)))))(((((((..........................)))))))(((....))))......)))...))..))))))...(((((.......))))))))))))....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((..(((...(((((..(((.(((..(((((..(((((((((.......))))))...)))..)))))..))).))).((((...))))........(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))............((((((...(((.((((((....(((.(((((...................))))))))))))))))).))))))..)))))..((((............))))((((....))))..((.(((((..(((...)))...))))))).)))..)))..)))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((..((......))..)))..(((..(((((..(((((((((.......))))))...)))..)))))..))).....((((...))))........(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))............((((((...(((..(((((....(((.(((((...................))))))))))))).))).)))))).........((((............))))((((....))))........(................)((((.......)))).)))))))....
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.(((...(((((......(((.......((((((...((((((..((((..((.......((((...((((.....))))...........((((((((((.....)))))))..)))...)))).))..))))..))))))))))))......)))........((((((...(((.((((((....(((.(((((.....((....))......))))))))))))))))).))))))..)))))....)))..........(((..((((....)))).)))..)))))..............(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))..((((.((((((((((((...(((((((.............)))))))..((((.....))))..............(((((((.....)))))))...)))).((((....)))).....))))))))(((((((..((((.......(((((.((((((.((((....))))((((((.....((((.............))))...)))))).))))))..........((((............))))((((....))))......)))))........))))....)))))))....)))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.(((...(((((......(((.......((((((...((((((..((((..(....)...((((...((((.....))))...........((((((((((.....)))))))..)))...)))).....))))..))))))))))))......)))........((((((...(((.((((((....(((.(((((.....((....))......))))))))))))))))).))))))..)))))....)))..........(((..((((....)))).)))..)))))..............(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((....))))))).((((.((((.(((((.(......)))))).(((((((((((((((.((.(((...))).)))))(((...)))...(((..(((((((((((......)).))))))(((((..)).))).(((((((.((((...).)))).)))).))).)).)))...).))))))..)))))))))))))..(((((((..))).))))((((.(((.(((((........))..))))))))))..(((((.....((((((((((....)))).).).))))..((..)).))))).((((......)..)))..)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((((......)))))))...........((..((((((.((((((..(((..(....)....(((...((((.....)))).....((((..((((((((((.....)))))))..)))..(((((......((((..((..(((......)))..))......))))......)))))..))))....)))...)))......((.........((....(((.((((..(((....))))))))))....))...........(((..((((....)))).))).....))............)))))).))))))...)).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((.(((...(((((......(((..(((((..(((((((((.......))))))...)))..)))))..)))......(((...............(((((((.....)))))))((((...(((((.(((........))).)))))...))))..))).......((((((...(((.((((((....(((.(((((.....((....))......))))))))))))))))).))))))..)))))....)))..........(((..((((....)))).)))..)))))..............(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....(((((((......)))))))....(((((.....)))))...((((((((..........)).))))))..((((.....))))..(((((....((((((((((.....)))))))..)))...((((....)))).))))).(((((..(((((...((.................))...)))))....))))).(((...................))).(((.((((..(((....))))))))))..((((............))))((((....)))).......(((..((....)))))..(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(((...{{{{{..))).(((...(((<<<...<<<)))(((((((...>>>....)).)))))...(((.....(((.....))).....>>>.((((((.....)))))).((((....((((....))))..(((((...)).)))))))...........)))..((((((((....[[[[[[.))))..(((........]]]]]].....))).))))..))).(((....)))..}}}}}..((((............))))((((....)))).......(((((.....)).)))..(((((.......))))))))))))....