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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00165



RNA: TMR_00165
Rfam family: tmRNA

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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((............)))))))).........((((((.((((((............))))))......(((((((....)))))))..((((((..((((((.........))))))((((..(((((((((((((((((.....................)))))))..((((((..((((....))))....))))))...........))))))))))...(((((....(((((((.........................)))))))..)))))...))))....)))))).....))))))..(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((((.(((....))).)))))))).(((((((((..((((((((.((((((((....(((((((.((...(((((((....)))))))((......)))))))))))...))).)))))).(((.(((((((((((((((((.((..(((........))))))))))))..((((((..((((....))))....))))))...........))))))))))))).))).))))(((((((..(((...............)))..)))))))...)))))))).)))...(((.((((.....((((((....))))))))))))).))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..(((((((((.(......).)))))))))...((((((((..)).((((((...(......).)))))).(((((..)))))((..(((((..(((........))).....)))))..)).((((((((((((((.............))))))))))))))((((((.(((.((..((((((.(.((((((.((...)))))))(...)..))))))))))))).).)))))....(((((((((..(((...(......)....)))..)))))))..))))))))..)))))).(((((.........((.(((((((...)..)))).)))).))).))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((((.(((....))).))))))))...(((((((..((((.((..((((((((....(((((((......(((((((....)))))))............)))))))...))).)))))..(((.(((((((((((((((((.((..(((........))))))))))))(.((((((..((((....))))....)))))).).........))))))))))))).))..))))(((((((..(((...............)))..)))))))...)))))))........(((.((((.....(((((......)))))))))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((.(((....))).)))))))).(((((((((..(((((((..((((((((....(((((((.((...(((((((....)))))))..........)))))))))...))).)))))..(((.(((((((((((((((((.((..(((........))))))))))))..((((((..((((....))))....))))))...........))))))))))))).))).))))(((((((..(((...............)))..)))))))...)))))))).).....(((.((((.....((((((....))))))))))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((......(((((....))))).....(((((((((....((((.((......)))))).(((.....)))........(((((((....)))))))......))))))))).(((..((((((....)))))).((((((...........)))))).))).((((.((((.(((((......))))).(((....)))..))))..))))......((((((..(((.......))).((((......))))......((((............))))......))))))......((((.............)))).(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((((((....))))).....(((((((((....((((.((......)))))).(((.....)))........(((((((....)))))))......)))))))))......((((((....)))))).((((((..[[[[[[...)))))).(((.......))).(((.{{{{.....)))}}}}.(((((.((.....))))))).....]]]]]](((.((((((aaaaa((((..<<<<)))).....>>>>..............))))))..AAAAA......)))..(((.....)))...)))..(((((.......))))).))))))....