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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00184



RNA: TMR_00184
Rfam family: tmRNA

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CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((.....................(((........................................((((.........))))...............................................................................................................................................................................................))).......................))))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((..(..(((((((((((((((((((((((.........)))).....(((((((......................((((((........(((((((((....))))))))).))))))((((((((.......))))))))...(((((((((.......((((...............)))).....)))).))))).........(((...)))(((((((....))))))).....)))))))........................)))))...)))))))))))))).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(...(..(((((.....(((((((((((((((((((.(...(((((............(((((((........((((((.........)))))).(((...((((((((((()))))))))))...)))((((((.(((...((((...(((((((((.((((....))))..)))))))))..((((((((.)))))))))))))))))))))....((......))(((((((....))))))).....)))))))(..........)....)))))..)))))...)))))))))))))))....)))))).)(((((.......))))))))))))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.......))).......(((((((((((((((((((((((.[[[[[[..)))).....(((((((......................((((((........((((((((((..)))))))))).))))))......((((.(((((...(((((((((.((((....))))..)))))))))..(((((((...))))))))))))((((......))))....))))(((((((....))))))).....)))))))...........(((...)))....))))))...))))))))))))).....]]]]]].(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((.....(((((((((((((((....((((.........)))).....(((((((............((((......((((((........(((((((((....))))))))).)))))).....))))....(((((((((((((((.((((....))))..)))))))))..(((((((...)))))))...............))))))......(((((((....))))))).....)))))))...............................)))))))))))))))....)))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((..(..((((..((..(((((((((((((.........)))).....(((((((........((((((.........)))))).(((...(((((((((....)))))))))...)))((((((.(((...((((...(((((((((.((((....))))..)))))))))..(((((((...))))))))))))))))))))....((.....((((((((((....)))(((.....))))))))).).....)).)))).))).....))))))...)))..))..)))).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(.......)((((((((((..(((((((.(((.(.((.(.((((((((...............)))))))).).))))))))).)))).(.((((((((((.(.(.((((((....)))))))).((((((((((((((((....))).))))))).)).)))).....)))))))))))..(..).(((..))).(((..(((...(((((......)))).).))))))((((((....)))))).....(((((((.(..((((((...(.......)(..).(((((.(......).)))))))))))..)))).)))))))))).)))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((.....((((..((..(((((((((......((((...............................((((......((((((........(((((((((....))))))))).)))))).....))))....((....(((((((((.((((....))))..)))))))))...(((((.....)))))..)).........................((((((....)))))).............................))))....))))))...)))..))..))))....)))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((.....((((..((..(((((((((...(.((((((((((((........((((............((((...((.((((((........(((((((((....))))))))).))))))))...))))..(((((...(((((..((.((((....))))..))..)))))..(((((((...)))))))))))))))).......))))...)))..((((((....)))))).......((((.((.......))))))..))))))..))))))...)))..))..))))....)))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((.((((.....))))..((((.......)))).))))).((((((...............))))))......((((((.........)))))).(((...(((((((((....)))))))))...))).((((..((((((.....))).))).....((((....)))).)))).(((.....)))...((((.....))))..((((......)))).....(((.((((((....)))))).......((((.((.......))))))....((((((....)).))))......)))..............(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((.((((.....))))..((((..aaaaa)))).))))).[[[[[[)))))).........]]]]]]......((((((.........)))))).(((...(((((((((....)))))))))...))).(((((.((((((.....))).))).(((.((((....)))).....(((((....<<<<.))))).>>>>.))){{{.)))))...((((}}}...))))(((((....)))))AAAAA...((((.((.......))))))....((((((....)).))))......(((((........((((....))))........))))).......