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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00193



RNA: TMR_00193
Rfam family: tmRNA

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((......(((.....((((...(((....(((...((((.......))))...................(((((...)))))(((((((..........)))))))...((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..)))))))))..................((((((..((((((...................)))))).((((((...(((...........(.(.(((....))).).).....)))....))))))..))))))....)))....)))..)))).....(((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((..(((((((((((((...........))))................((..(((((((.((....)).))))))).))((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..)))))))))..........((((((((((....(.((((((...................)))))).)...))))))))))..(((((((....(((....))).......)))))))......))))))....))).)))....)))..))))...(((((.......))))))))))))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((......))))).....(((((((..((((.......))))..........(((......(((((...)))))(((((((..........)))))))...((((((......)))))).((((((((((((.(((((................)))))(((((((........((((((..((((((...................)))))).((((((..........(((((((....(((....))).......)))))))..))))))..)))))))))))))..)))))))))))))))))))))).........)))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((((......))))).....(((((((..((((.......))))................................(((((((..........)))))))...((((((......)))))).((((((((((((....(((((......((((....)))).....))))).....((((((..((((((...................)))))).((((.(((((.(((((...))))).)))))..)))).........................)))))).........))))))))))))...))))))).........)))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((...((((.......))))........(((.....................(((((((..........)))))))...((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..))))))))).(((((((((((((((((((....(.((((((.....((((.....)))).)))))).)...))))))))))).(((((((....(((....))).......)))))))..))))).)))..)))....)))....)))..))))...(((((.......))))))))))))....
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((...((((.......))))........(((.((((((..............(((((((..........)))))))...((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..)))))))))..)))))).(((((((((((......((((((.....((((.....)))).)))))).....))))))))))).(((((((....(((....))).......))))))).............)))....)))....)))..))))....((((.......)))).)))))...)).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((...((((.......))))........(((((((....((((.....))))....)))).......(((((((.(((.((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..))))))))).........(((((((((((......((((((.....((((.....)))).)))))).....))))))))))).(((((((....(((....))).......)))))))..)))))).)))))))....)))....)))..))))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(((((((((..))))))))((((((((((.(.((((.......)))).((((...............))))(((((((.(((((((.(((...)))))))))).(.((((((......)))))))(((((((((((((((......))))))))))))))).)))))))(..).((...((((((..(........)))))))..(..)..((((((((((...(((((.(((((...)))))).))))((...(.......)....)))..))))))))).....)).))))))))))).)..(((...(........)..))).)))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((...((((.......))))................................(((((((..........)))))))...((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..)))))))))..........((((((((((......((((((...((.....)).......)))))).....))))))))))..(((((((....(((....))).......)))))))....................)))....)))..))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.............((((...(((....(((...((((.......))))..((((.(((..((((((..............(((((((..........)))))))...((((((......)))))).(((((((((..(((........)))..)))))))))..)))))).(((((((((((......((((((...................)))))).....))))))))))).(((((((....(((....))).......))))))).....)))))))........)))....)))..))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....(((((......)))))..((((........((((.......)))).........)))).......(((.....))).(((((((..........)))))))....(((((......))))).(((.((((((.((((.....))))....((((....)))).....(((((......)))))..((((((...................)))))).((((.((((..((((.....))))..))))..)))).........)))))).((((......))))....))).................(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((....(((((......)))))..((((........((((.......)))).........))))......((((.....)))).((((((..........))))))..((.{{{{.)).((((}}}}....)))).....(((.....))).((((.(((....))).(((..[[[)))....(((]]]..)))..((((..((((.....)))).(((.....))).(((((((.((.....))))).))))...)))).(((.....)))...((((.((........)))))).......))))......(((((.......))))).))))))....