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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00248



RNA: TMR_00248
Rfam family: tmRNA

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..((((....((((((((((((((.(((((((...)))))))...((((.........))))..............(((........)))..))))......................(.((((.(.((((((((....))))...(.((.((((....((((((((...............))))))))....)))).)).).............)))).).))))..)..........))))))))))((((............))))........))))..).........(((((.......))))))))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((((..(((((.(((((((((.(((((((...))))))).).))))))))))).)).((((.............)))).(((((((..(((..(((..((((((..((((..((((((........((((((....))))))...((..(((....((((((((((..((....)).))))))))))....)))..)).((((..((.....))..))))......(((((....)))))...))))))...))))..))))))..)))....))).)))))))...((((....))))..))))...)))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((......((((((((..(((((((...)))))))...))))))))..............................((((((.((((......)))))))))).......(((((((...(((((((((.........((((..((((....((((((((((...........))))))))))....)))).....))))...........(((((............)))))....................)))))))))..(((((...))))).....)))))))))))))))))).....))))))....
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RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((.(((((.((((((((..((((((.....))))))...))))))))))).)).........................(((((.((((......)))))))))))))))))....)))))))).(((((....)))))............(((((..((((((((((((((((((.((........)).)))).))))).............(((((............)))))........))))))..)))....)))))....(((((((.((((...))))...(((((.......))))).))).))))..
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((..((((((.(((((((((.((((((.....)))))).).))))))))))).))..........(((((.........((((((.((((......)))))))))).((((....((((((....((((((....))))))...((.((((....((((((((((...........))))))))))....)))).))..((((((((((.....))))))....((((((....)))))).))))...))))))....))))....))))))..))))............(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((..)))....((........)).((((((((...)))))))).((((((......).)))).((((((..))))))((((((((((((.((((......))))))))))...(((((.((....))..)))))...((((.......))))(((((..(((((((((.....((..))..))))))))))))))(((((((((.(((.....))).).).)))))))...((((..)))))))))).(((((((((((((...))))))))).))))..((((...)))).).(((((.((..))))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((..(..(((.(((((((((.(((((((...))))))).).)))))))))))..............................................(((((..(((....(((...........(((((....)))))...............((((((((((...........))))))))))..........................................................))).....)))..)))))..............................)..))))))).....)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((..(..(((.(((((((((.((((((.....)))))).).)))))))))))....................((.((.(((((((..(((..(((..((((((..((((..((((((........((((((....))))))...((.((((....((((((((((...........))))))))))....)))).)).................(((((............)))))......))))))...))))..))))))..)))....))).)))))))..)).))..)..)))))))).....))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.(((((...........))))).....((((((.....)))))).((((.......)))).(((((.............)))))....(((.((((......))))))).(((..........))).(((((.((((....))))..............(((((....)))))..)))))...(((((.((((....))))...((((.............))))......)))))....(((((......((((..........))))....((((.....))))...)))))..(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((..((((((...........)))))).(((((((((.....)))))..((((.......)))).(((((.............)))))....)))).(((......))).....(((......{{{{))).(((((.((((....)))).}}}}.........(((((....)))))..)))))[[[[[[...((((....)))).))))...((((((.....))))))....((((((....)))))).....((((]]]]]]....)))).....(((((((.(((.....)))...(((((.......))))).))).))))..