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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00274



RNA: TMR_00274
Rfam family: tmRNA

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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.......((((((.....))))))(((((((.......(....((.(((((((..(((..(....)))))))))))..))....((((((........).)))))(((.((((.(((((.......))))).)))))))......)((((((((((((((......((((........)))).)))))))).(((((((((..(....)...))))))))).....(((..((((((((((((..(((((.((((....))))..))))))))))...))).))))))).........)))))).....)))))))...............(((((.......))))))))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.((((((.....)))))))))..((((..(.(..(((((.(((((((...((........)).)))))))........(((((.(........))))))........)))))).)......(((((.((..((((((((((((((((...(((.(((((.((((........))))..)))))...(((((((((...........))))))))).....(((..((((((((((((..(((((.((((....))))..))))))))))...))).)))))))...)))..))))))).................)))))))))..)).)))))..))))..)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.(.((.(((((((.....)))))))))..(((((.((((((((((.(((((((.....(((....))).)))))))........((((((........).)))))........)))))..)))))..(((((.((..((((((((((((((((...(((.(((((.((((........))))..)))))((((((((((((..(....)...)))))))))..........((((((((((((..(((((.((((....))))..))))))))))...))).)))))))...)))..)))))))....((....)).....)))))))))..)).))))).)))))).)))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....((.(((((((...)))))))))((((((.(..(((.(((((((((((((((...........)).)))))))).)).(.((((((((......)).)))))).).))))))..))).))))(.(.......))(((((((((((((((((...((((...))))((((((..(..(........)..((((((((((.(........)))))))))))...).(.(.((((((((((((..((((((((........))).))))))))))...))).)))).)))))))).))))))))(((..)))(((..))).))))))))).((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((.((((((.....)))))))))..((((..((((((((((.(((((((......((....))..)))))))........((((((........).)))))........)))))..)))))..(((((.((..((((((((((((((((...(((.(((((.((((........))))..))))).(.(((((((((...........))))))))))....(((..((((((((((((..(((((.((((....))))..))))))))))...))).)))))))...)))..)))))))....((....)).....)))))))))..)).)))))..))))..)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...((((.(((((.....)))))))))..(((((.((((((((((.(((((((.....(((....))).)))))))........(((((...........)))))........)))))..)))))..(((((.((..((((((((((((((((...(((.(((((.((((........))))..)))))...(((((((((...........))))))))).....(((..((((((((((((..(((((.((((....))))..))))))))))...))).)))))))...)))..)))))))....((....)).....)))))))))..)).))))).)))))..)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((....(((....))).((((.((..........))))))...(((((((................)))))))........((((.((........))))))....((((.(((((.......))))).)))).)))))).(((((((((......))).))))))(((((......)))))..((((.(((((((((...........))))))))).............((((....))))......(((....))))))).((((((.........)).)))).............(((((......(((.....))).......(((((.......)))))..)))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................