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GGGGACGCACUGGUUUCGACGGGGAUGUGGAAACCAAAGUGGCAGGUCGAGGCGCCGCUGGCCUCGUAAAAAGCGGCAACAAUGUAAUUGCAAACAACAAUUACGACUACGCUCUUGCUGCAUAAGUAAUAGCGUACCUGGCUAUUUAAAUAGCCACGUCAAUCCUGCUGAUGUCUGAUAAGCUGGUGCGGCGACAAUCAUCAGGCUAGCAGCCUAUUGUGUUUACUGGAUAGUCUGCGAAAUUAUUACAGUAAACUUGUUUUGAUCUGCCUGGCUAAGGGCUAGAAUCAAAAUAAGAUGUAAACUUAGCCUAAACCUGUAGAUACUUUGUGUGGAACUUUCUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGUCUCCACCA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.((((((.(((....))).))))))((((((((((((..((((((((((............)))))).((((((((((((.......)))))))(((((((((.(((((.....))))).))))))..(((((((....))))))).)))....((((((..(((((((..((....))(....)....)))))))))))))...))))).(((((((((((((.......)))))).)))))))(((((((((((((((((......)))).))).))))))))))...........))))..))))))...)))))))))))...........((((((((.......))))).)))))).)). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((.(...))))))..(....)((((.(.(.(((((((.(((((((.(((((((((...(......).)))))).((((((((((((.((..))))))))).((((....(.(........))...))).(....((((((......))))))...).((((((((((((((((((.............)))))))))))).).)).)))).)))))(((((((((((((.(......)))))).))))))))...(((((..((((((..(..))))).))...)))))((((((...))))))))).)))))))...).)))))).)(......)....((((((((((...)..)))).)))))))).)) |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((.(((((.((((((.(((....))).)))))).(((((((((((..((((...(((((((....................(((((((.......)))))))(((.(((((.(((((.....))))).)))))...(((((((....))))))).))).....................(((.....)))...........)))))))...........(((((((((((((.......)))))).)))))))((((((((((.((((((......)))).))..))))))))))...........))))..))))))...))))).)))))...........((((((((.......))))).))).)).)). |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....(((((((..((....))..))))))).((((((..........))))))....((((.....))))......((((((((.......))))))))..((((((.(((((.....))))).))))))...((((((....)))))).(((((.......))))).....(((..((((.........))))..((((.....)))).))).(((.....))).(((((((...((((....))))....(((.((((((((((......)))).))).)))...((((.......)))).....))).)))))))..((((.............)))).(((((.......))))).)))))).... |
|
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....(((((((..((....))..))))))).....(((((((((((.aaaaaa..))))).....AAAAAA.....((((((((.......))))))))....((((..((((.....))))..)))).(((.((((((....)))))).(((((.......)))))..bbbb..bbb)))..BBB....BBBB..((((.....)))).((((....[[[[[[[[[[..)))).]]]]]].]]]].......(((((.((((((({{{...)))).)))..}}}))((((.......)))))))...))))))..(((.....))).(((...........<<<<<)))....>>>>>.)))))).... |
