RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00357

RNA: TMR_00357
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((((......(((((((((((((((....))))(((((((((..((((((......(((.((((((..(((....((((((((..(((((...)))))...))))))))..(((......((((((.........................))))))(((((((((...)))))))))..(((..((.((((((((((..............))))))))))))..)))...))))))...)))))))))........))))))..((((((((....((((....)))))))))))))))))..))))........)))).......))))))).......))))))))))...(((((.......))))))))))))....
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((((..................((((....))))......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................)))))))))...(((((.......))))))))))))....
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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((........)))))...............((((((....(((....)))............(((.......)))...............))))))((((((.......[[[[[[.......))))))...]]]]]].((((((.........................))))))(((((((((...))))))))).....(((.[[[[[[)))..]]]]]]...(((((....(((..(((((((((....))))).)))).....)))..)))))......(((((((((.....[[[[[[[[[..)))))))))......]]]]]]]]]......((((((.......)))))).(((((((..[[[[[.......)))))))........]]]]]..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((...(((...(((((...(((....))))))))...))).)))(((((.((.....(((.......))).......))..)))))..((((((((..(((((...)))))...))))))))...........((((((.........................))))))(((((((((...)))))))))..(((((((((........))))))))).(((((.((((....(((((((((....))))).))))...))))...)))))...((.(((((((((....((((....))))))))))))))).(((((((....((.....((((((.......))))))..))....))))))).(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((((((((((......(((((((.....((([[..)))......((((..(((.......)))..................((((((((..(((((...)))))...))))))))...........((((((.........................))))))((((((((.....))))))))....((((..((((((((((..............)))))))))))))).......................]]...............((((((((.((...........))))))))))))))..................<<<<....)))))))>>>>...)))))))))).....{{{.))))..}}}..)))))))....
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..................................................................................................((..(...((((.........................))))))).((..((((((......(.......))).........).....)))))......................(.((((((((.(..........))))))))))............................(((........((((((.(((......)).).).)))..))))).........................................................(((((.......))))))))))))....
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((((......((((((((((((((((..)))))....((((((.((((((..................(((((((((((......(((((...))))).(((((((..............((((((.........................))))))(((((((((...)))))))))..........((((((((((..............))))))))))........)))))))..)))))))))))........))))))...(((((((.....[[[[[[[[[..)))))))))))))..]]]]]]]]]...)))).......))))))).......))))))))))...(((((.......))))))))))))....
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.jjjj(ii((((({{{{{(.....((((((.hhhhhhhhhhhh.((..fffff.)).hhhhhh..))))))...((((((.((((..))))((((((((.eee.HHHHHH.eeeee.)))))))).kkkb...d(.((((((EEEEE..mmm(.FFFFFggggg...))))))(((((((((lll)))))))))cccccccc))dddd(()GGG))))))<<<<<<<<<<<<DDDDB).GGMMM.((.)CCCLLLnnnnnn(()CHHH...nnn.nnn.))aaaaaaaa()))))iiiiiiiii..AAAAAAAA))JJJJ.IIIIIIIIINNN.CCCCDKKK))NNNNNNHHHHHHHHH)}}}}}.>>>>>>>>>>>>.IIEEE.NNN)))))))....
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(...((..((((((((......(((.(((......(((((............)))))..........(...(....................................................................................................((.((((.....)))).))...........((((((.((((..........))))...))))))...................((((((((.......))))))))...............(((((((((.(((.......)))...)))))))))..........))....))).))).......)))))))))))((((((...)..))))))))).)).)..
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RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................(((((((........................................................................................................................................................................................................(((((.......................)))))......((((...............))))...............((((((((..(((.......)))....))))))))..............................)))))))................................
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((........)))))....((.(((((.((((((.((((((((....))).((((((.((.((((......((((...............((.((((((((..(((((...)))))...))))))))..)).......((((((.........................))))))...))))........)))).)).))))))..((((((((((...((.....))..)))))))))).......))))))))))).))))).))..))).(((((((((.(((((((((....((((....))))))))))))).....................((((((.......))))))..))).))))))(((.(((((.......)))))....)))....
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..((((((..((((((.(((((.((.(((((.................(((.......)))............(((((((((((((((.(((((...)))))......))))))((((......((((((.........................))))))((((((((.....))))))))(((.((((..((((((((((...((.....))..)))))))))))))).)))..))))....)))))))))))))).)).........((((((((....((((....)))))))))))))))))..)))))).........((((((.......))))))...))))))..))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((....((((.((((((.............)))))).))))...)))).)..(((((.((((.(((((.(((((.(((((.......).(((((((.(.(((((...))))))...)))))))...........((((((((((...............))))).).))))(((((((((..)))).))))))))))))))(((((((((((..............)))))))))))))))).)))).(((((((((((((((...(..).(....((.(((((((((.((((......)).)))))))))))))...)..(((........)))..)).))))))))))))))))))(........).((((((...)..))))))))))))....
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........(..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(.........)...............)..((.......).)..)))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..((((((..((((((.(((((.((.(((((................................................((((((((..(((((...)))))...))))))))...........((((((.........................))))))(((((((((...)))))))))..........((((((((((...((.....))..))))))))))...........................))))).)).........((((((((................)))))))))))))..)))))).........((((((.......))))))...))))))..))....((((.......)))).)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..((((((..((((((.(((((.((.(((((.................(((.......)))...((((((.........((((((((..(((((...)))))...)))))))).((((......((((((.........................))))))(((((((((...)))))))))....((((..((((((((((...((.....))..))))))))))))))......)))).....))))))..))))).)).........((((((((....((((....)))))))))))))))))..)))))).........((((((.......))))))...))))))..))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((........))).(((.(((..((((....))))....(((......))).......))).(((................))).........((((((((..((((.....))))...))))))))..))).......(((((.........................))))).((((((((.....)))))))).....(((.((((((.....)))))).(((.......)))....))).((((....)))).((((....)))).....((((.....(((((((((.((...........))))))))))).....................((((((.......))))))...))))...(((((.(((((.......)))))....)))))..
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