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GGGGCUGAAAGGUUUCGACUUCGCGCAUCGAAUCAAGGGAAGCGUGCCGGUGCAGGCAAGAGACCACCGUAAGCGUCGUUGCAGCAAUAUAAGCGCCGAUUCAUAUCAGCGCGACUAUGCUCUCGCUGCCUAAGCGAUGGCUAGUCUGUCAGACCGGGAACGCCCUCGUCCCGGAGCCUGGCAUCAGCUAGAGGGAUCUACCGAUGGGUUCGGUCGCGGGACUCGUCGGGACACCAACCGCGACUGGGAUCGUCAUCCUGGCUAGUUCGCGUGAUCAGGAGAUCCGAGUAGAGGCAUAGCGAACUACGCACGGAGAAGCCUUGAGGGAAAUGCCGUAGGACCCGGGUUCGAUUCCCGGCAGCUCCACCG |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................................................................................................................................................((((((.........................)))))).................(((((((((((.......)))))))))))..........................((((((.............))))))......................................................................................... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((.........((.((((....((((((....(...((((((((((((...(((..........)))..)))..........((((.(((....))).))))(((((.(((.(((((.....))))).))))))))((((((.(((((..((....)).)))))...)))))).................(((((((((((.......)))))))))))...............(.(((((....(((((((..........).))))))))))).)................)))))).))).)...)))))).....))))))..................))...))))))).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((((((.......(((.((.........)).))).(((......)))..)))))).((((..((((.(((((..........((((.(((....))).))))(((((.(((.(((((.....))))).)))))))).(((((.((((((.((....))))))))...)))))..........((..((..(((((((((((.......)))))))))))))..))..((...(((.(((((....((((((.............))))))))))).)))...))....)).))).))))))))......((((.((......)).))))..(((((.......)))))))))))).... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((...((((.....))))..........((((((((((............)))))....((((((((((((.......((((............))))............)))))...))))))).......((((((.((((((.........))))))...))))))...(((((...(((((.((((((((((..[[[[[[[))))))))))........]]]]]]]..)))))......)))))((((((((..((((....))))..............)))))))).)))))..))))))))..(((((........(((((..)))))..)))))..))))))).... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..................(((((((...)..(((((((....(((((((((((..(((...(((..........)))..)))..........))))))((....))(((((...........((((((.........))))))...((((((......(.........)........)))))).................((((((((((((....).)))))))))))...........)).)))(((((.((......((..........).)...)))))))..((((............)))))))))......))))))).......))))))............................... |
|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........(....)..........((((((....(((((((((((..(((...(((...(....).)))..)))..........))))))........(((((..........(((((((.........)))).....((((((.((((((.........))))))...)))))).........))).....((((((((((.........))))))))))...........)).)))(((((.((........................)))))))..((((............)))))))))......))))))..................................))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((........((...........))......((((.((((.(((((....(((...(((...(....).)))..)))..........((((.(((....))).))))(((((.(((.(((((.....))))).))))))))......)))))..))))..(((.(((((..(((((((.......((((........((((..(((((((((((..................)))))))))))..)))).....(((((((((((..((((....))))...(......)...)))))))).)).).......))))........))))..)))..)))))..))).))))..))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...........((.((.((((....((((((....((((((((((............)))))...((......))..........((((.(((....))).))))(((((.(((.(((((.....))))).))))))))((((((.((((((.((....))))))))...))))))...((....((..((..(((((((((((.......)))))))))))))..))....)).(((.(((((....((((((.............))))))))))).)))..................)))))......)))))).....)))))).))...(((((.......)))))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....((..((((.((.(((((((((((..((...((.(((....))).)).(((..((.......(((....))).((.......((((.(((....))).))))(((((.((..(((((.....)))))..))))))).(((((.((((((.((....))))))))...)))))....))....))..))).))....)))))))).))).))...))))..))...........(((((((((....(((((.((((((((..((((....))))...((....))...))))))))...((((.....((.....)).....)))).....)))))..)))).)))))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...((((((......((((...............))))(((......)))..))))))...((((......)))).(((......((((............)))).....)))...((((.....)))).((((......))))..((((((.((....))))))))...(((((....))))).((((...(((((.....))))).((((.(((.((((((.......)).)))).(((((....)))))....)))))))..((((....))))...((((............))))..((((...................)))).((((....))))...))))..))))))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....)))))).....(((((...............))))).(((((.<<<<.......)))))..(((((.(((.....)))....((((............))))[[[[))))).(((((]]]].))))).(((.>>>>.)))...((((((.((....)))))))).(((((((....)))....(((((((....))))))).(((....)))..((((((.......)).)))).(((((....)))))...{{{{{{{{..((((....)))).......))))...}}}}}}}}.....((((....(((..((......))..)))..(((((.......)))))...)))).... |
