RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00374

RNA: TMR_00374
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((..(((((.....((((.(((((..........))))).)))).(((((((((....((((..(((((.((((((............(((((.(((((..((((..........))))...)))))))))).(((......)))..)))))))))))..))))......(((((((..(((((((((((((..........))))))))))..)))...)))))))..((((((((((.(((((((.....(((((............))))).....))))))).((((((((...........)))))))).)))))).)))).....)))))))))...)))))....)))....))))..(((((.......))))))))))))....
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((((.......((((..((((.(((....)))...((((((....................................))))))...............................((((((((((.......(((((.(((.......))).))))).....))).....((((((((((..........))))))))))(((....)))......(((((((.............))))))).................((((((..((.((((........)))).))..))))))......))))))).........)))).....)))).......))))))))))...(((((.......))))))))))))....
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....)).((((((((((.........(((((.((.(((....)))(((((((((.((..(((........)))..)).............(((((((..(((...((((((((...(((....))).((((...((((((....(((((.(((.......))).)))))..))))))...))))((((((((..........)))))))).)))))))).))).))))))).........(((((((.....((((..((((....)))))))).....))))))).((((((((...........)))))))).................)))))))))....)).)))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....(((((..((((((((((........(([[[[.[[((((....)))).(((((((...................((((((((.....................................................((((((....(((((.(((.......))).)))))..)))))).....((((((((((..........))))))))))............................................................{{{{{{..{{.{{{))))))))..}}}.}}..}}}}}}.....................)))))))....))]].]]]].)))))))))))))))(((.......)))..)))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(.((((((((.........(((((.((.(((....))).((((((((.((..(((........)))..))...........(((((.(((((.......................)))))))))).(((......)))..(..(((.......)))..)((((.....))))....(((((((((..........)))))))))...(.........)...............(((((((.....((((..((((....)))))))).....))))))).((((((((...........)))))))).................)))))))).....)).))))))))))))).)...(((((.......))))))))))))....
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.nnnnnnnnnn)))((iiiiii((((((af((.((((((((..))))jjjjjjjjNNNNNNNNNNjjjjjj))))lllllllll.l(.oooooooooo(.pppppppppppppp)).)A))))F)(((.(((<((.((((((.eeeee(kkkkkkkkkkkk.kkkk(gggg..))))))[[[[.(((((((((m((ccc)GGGGM)))))))))PPPPPPP[[.[[)PPPPPP..)PKKKKbbbb({{{)O.)EEEEE>)))OOOO)}}}BBBB..JJJJJJKKhhhOOOOOLLLL.hh.LLLLLL)))..CCC..]].KKKKKKKKKK..)).JJJJJJJJ]])))(((((ddHH]]]])))))DD(((((.IIIIII)))))))))))).HHH
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(...((..((((((((.....((((.(((.(((((....(((............)))..........(...(...........................................................................((.((((.......)))).)).............(((((((.((((..........)))).)))))))..............((((((((...........)))))))).................((((((((((..(((........)))..))))))))))..................))..)))))....))).)))).....)))))))))))((((((...)..))))))))).)).)..
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((........))))((.((((((((...)))))..)))))((((..))))..(((((((((((..(((((((...(((((((((((...(((((((((.((((((..(((((......).))))..))))))))))...((((((..((((...))))..................))))))......(((((((((((......))))))))))))))))...((((((((((((((((.............))))))).((((((......)).)))).)))))).))))))))))))).(((((..)).).)).).))))).))..))).)..)))))))((..))..((((........)))).((.(((((...)..))))...))))).)).
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..((((((.(.....).(((((.((((((....)))(((((((((...(((((...........(((((((..........(((((((..(((...(((((((................(((...((((((....(((((.(((.......))).)))))..))))))...))).((((((((..........))))))))..))))))).))).))))))).........(((((((.....((((..((((....)))))))).....))))))).))))))).)))))...............................)))))))))...))).)))))))))))..))....................)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..((((((.........(((((..(((((....))).((((((((.......(((((.(((.((((((((...........(((((((..(((...(((((((...............((((...((((((....(((((.(((.......))).)))))..))))))...))))((((((((..........))))))))..))))))).))).))))))).......((((((.......))).))))))).)))).))).((((((..((..(((........)))..))..))))))...........))))).....))))))))....))..)))))))))))..))...(((((.......))))))))))))....
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