RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00393

RNA: TMR_00393
Rfam family: tmRNA

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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((..((((((((....(..((((((((((..((((((((((...((((.((((.........))))))))....)))))))...)))......((.........)).(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.(.....).))))))((((.....(((((.....)))))...)))..).(((((((.........)))))))...(((((((......)))))))...............))))))))))..)...)))))))))).(((((.......))))))))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((...[[[[[.)))).....]]]]]....((((((((((........((((...[[[[.[[[[)))).....]]]]]]]]..(((.[[[[[)))....]]]]]..............(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.........)))))).........((((.[[[[[[))))..........(((((((.........)))))))...(((((((......))))))).......]]]]]]..)))))))))).............(((.[[[[[)))....]]]]]...........
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((...((..((((((((((..((((((.(((..(((........)))..)))......((((((.(((((((.....))))))).............(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.((...)).)))))).........(((((.....)))))...)))))).(((((((.........)))))))...(((((((......)))))))...))).))).....))))))))))...)).))))))))...(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((.......((((((((((......((((((...((((.((((.........))))))))....))))))...........................(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.........)))))).........(((((.....)))))..........(((((((.........)))))))...(((((((......)))))))...............))))))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((.........((((((((((((((((.[[[[[[..((((.((((.........)))))))).))))))..(((((((.....................(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.........)))))).........(((((.....)))))..........(((((((.........)))))))...(((((((......))))))).....)))))))...))))))))))..]]]]]]))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((.......((((((((((..(((((..((((..((((.((((.........)))))))).....(((((((.....)))))))......))))...(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.........))))))))))).........((((((..............(((((((.........)))))))...(((((((......))))))).......))))))..))))))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((((((((..(((((.((((((((((((((.(.((((.((((..(........))))).......((((((((((((((((((..((.(((.((((..((.(((..........)))....((((........))))))...((((((..((...)))))))))))).((....))))))))))))))).)))))).))))((.(((((...))))))).))))((((((......)))))((........)).).).)))))))))))))(((..))).))))))..)))))))))).)).)))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((....(..((((((((((..(((..(((((...((((.((((.........))))))))....))))).)))........................(((((.(((((((....)))))))..)))))...((((((.(.....).))))))................(((...............(((((((.........)))))))...(((((((......)))))))........)))....))))))))))..)...))))))))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((.......((((((((((..((((.(((((...((((.((((.........))))))))....))))))))).........((((((.........(((((..((((((....))))))...)))))...((((((.(.....).))))))..........)))))).....((((.........(((((((.........)))))))...(((((((......)))))))........))))...))))))))))......))))))))...(((((.......))))))))))))....
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