RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00433

RNA: TMR_00433
Rfam family: tmRNA

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((.......(((((..(((((..(((((..(((((((((((............))))).(((((((.(((((...........))))).........((((((.(((.........))))))))).))))))).(((((((.(((((((((...))))))))).......(((((((.(((((....((((((..((.................)).....))))))....((((((((........))))))))....))))).))))....(((((((((....(((....)))..)))))))))))).....)))))))......)))))).....)))))..)))))))))).(((((....)))))..)))...)))))))....
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...........(((((((..(((((.((((((..(((((((((((((.....))...))))).(((((((.(((((...........))))).........((((((.(((.........))))))))).))))))).(((((((.(((((((((...))))))))).....(((((((..((((((..........)))).....)).)))))))((.((((.((((((....(((......))))))))).))))..))................(((((((((....(((....)))..)))))))))........)))))))......)))))).....)))))).)))))))))).))...(((((.......))))))))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............(((((..(((((.((((((..(((((((((((............)))))........................((((....))))................................................(((((((((...))))))))).....(((((((....((((..........))))........))))))).........((((.....(([[[[[[[.)).))))]]]]]]]...................(((((((((....(((....)))..))))))))).....................)))))).....)))))).))))))))))......(((((.......))))))))))))....
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............(((((..(((((.((((((..((((((.((((............))))..........(((((...........)))))......(.(......).)...........(((((.(((((...)))))))))).(((((((((...))))))))).....(((((((....(((............)))........)))))))...((((.((((((....(((......))))))))).))))....................(((((((((....(((....)))..))))))))).....................)))))).....)))))).))))))))))......(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............(((((..(((((.((((((..(((((((((((.........[[[))))).........(((((...........)))))......(((....)))..(((.....(((<<<<<.<<<<<)))>>>>>>>>>>.(((((((((...))))))))).....(((((((....((((..........))))........)))))))...((((.((((((....(((......))))))))).)))))))......(((.....)))(((((((((....(((....)))..))))))))).]]].................)))))).....)))))).)))))))))).((((.{{{{{))))...}}}}})))))))....
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...........(((((((..(((((.((((((..(((((((((((...(....)...)))))...((((..(((..(((.......((((....))))(((((((.(((((..((((((((...........)))))..)))....(((((((((...))))))))))))))))).))))...(((......)))...))).........(((((((..((((.((((((....(((......))))))))).)))).))..........(((((.((((..(.....)..))))..))))))))))..............)))..))))..)))))).....)))))).)))))))))).))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..)))..((((((((..(((((((((((((..(((((((...(.(((((((.((.(..((((..(((((((((...........)))))).))..)..)))).(((.((((((((((((((....).)))))))..)))((((......)).))))))))(((((((.((.((......).))).))))))).)))))))))).(((((((((((.((.......)).)))))))))))...(((((((..............))))))).(..((((((((((((..(((..)))))))))))))))..).(((..))).(..)).))))))).....)))))))))))))))))).)))..((((((...)..))))))))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..............((((..(((((.((((((..((((((..................((((..............(((...........((......(((....))).....))......(((((.((((.....)))))))))..))).............(((((......................)))))........................((((.((((((....(((......))))))))).))))............)))).....((((((((....(((....)))..))))))))......................)))))).....)))))).))))))))).......(((((.......))))))))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...........(((((((..((((..((((((..(((((((((((((.....))...)))))...((((..(((..(((.......((((....))))(((((((.(((((..((((((((...........)))))..)))....(((((((((...))))))))))))))))).))))...(((......)))...))).........(((((....((((.((((((....(((......))))))))).)))).............(((((.((((..(.....)..))))..))))))))))..............)))..))))..)))))).....))))))..))))))))).))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....((((((....(((.((((...........)).)))))......(((((............)))))........))))))...........(((....))).(((......))).((((......(((((..(((.....))).))))).(((((((.......)))))))....((((((.(((((((((..........))))...((((..........))))...)))))...((((......)))).)))))).))))..........((((...(((((((.....)))))))..((((((((.((.........))..)).))))))..((((.......))))...(((..........))).((((.......))))....))))....
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