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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00448



RNA: TMR_00448
Rfam family: tmRNA

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............................................(((((((((........))..))))))).......((((((..........))))))....((((((((.....))))))))((((((...(((............)))....))))))..................(((((..((((............................(((((((((((..((.....((.......)).))..)))))..........))))))..........................)))).)))))..(((((.......))))))))))))....
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.......)........................(((()))).(((..(((((((((........))..))))))).......((((((.(......).)))))).)))((((((((.....))))))))((((((...(((..(.......).)))....))))))..................(((((.(((((.((((........((((.....(.....(((((((((((..((.((..(((.....))))).)))))))..........)))))).....)......)..)))...)))).))))))))))..(((((.......))))))))))))....
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((.(((.....((((.(((((.((.(((..(((((((....((......))))))))).......((((((.(......).)))))).(((((((((((.....)))))))).))).)))..)).))))).......(((..(((.(((.(((...((((.((.......))..)))).)))))).)))..)))......))))..(((((((((((..((..((((.....))))..))..)))))..........))))))........)))....(((....)))...)))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((.....((((((.(.(((...((((((..(((((((....((......))))))))).......((((((.(......).)))))).))))(((((((.....)))))))(((((((...(((..((....))..)))....)))))))...........))...))).))))))).(((((.......))))).....(((...(((((((((((..((..((((.....))))..))..)))))..........))))))((((...............)))).))).)))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((......(((((.(((((((....(((((..)))))(..).(((...((((((((..((((..........(((((.((((.(((((((.(......).)))))))(((((((((((.....)))))))).))).(((.((((.((((((((...((......)((((((...))).))).(...(......)....)(.((((((...)))))).))....)))))).)))))).)))..((..((........))...)))))).)..))))))))))).)))).)...))).))).).).)).)))))..((..))(((((.((..))))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((............................(((((((....((......))))))))).......((((((.(......).))))))....((((((((.....))))))))((((((...(((............)))....))))))..........................................................((((((((((.........................)))))..........))))).............................)))))))...(((((......))))).)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((....(((((.((.(((................((((((.((.(((..(((((((....((......))))))))).......((((((..........)))))).(((((((((((.....)))))))).))).)))..)).)))))).....((((...(((((((........))))..)))((((((.((((.((((.....((.((((((...((....(((((((((((..((..((((.....))))..))..)))))..........))))))....))....)))..))).)))))).)))))))))).))))))))).)))))...)))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((...............))))............(((((..(((.....))).((((.................)))).......((((((..........)))))).))))).(((((.....))))).(((....)))(((.....)))...............((((........)))).....(((((..((((((((((((.((..........)))).))))))..(((((.......(((((.....)))))...)))))....((((.....))))...........))))....(((.....)))))))).((((((........)))))).........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((.{{{{{......{{{)))).......}}}}}(((((.....((((..(((((((..............))))))).......((((((..........)))))).))))..(((((.....))))).(((....)))(((.....)))...............(((((.....)).)))....((((........[[[[[[[[.[[..))))....]]]].]]]]]]..))))).......(((((.....)))))...(((((....((((.....))))..................((((.....))))}}}...(((((........))))).)))))....