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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00465



RNA: TMR_00465
Rfam family: tmRNA

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CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.........(...............................((((((........)))))).......................((((....)))))...(((((((((.(((((((................)))))))....((((((((((.(................((((((((........(((.((((((((((...))))))))))))).........................((((........))))..))))))))..................)..))).)))))))....)))))))))..........(((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((......((((.(((..(((((.((.(((((((((...............))))))))).)).........................(((((......((((((......(((((((((...................)))))))))....((((............))))..((((((((((...))))))))))))))))....))))).....(((...((((((........)))).))...))).......................))))).....))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((((((..................((((.....((((((((((.(....).))))))........))))..)))).....((((....))))))).(((((((((.(((((((.(((.....)))....)))))))((..(((((((((((((.......(((.....((((((((........(((.((((((((((...))))))))))))).......(((.(......))))...((((........))))..))))))))...)))...........))).))).)))))))))..)))))))))))))).....(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.((((.(((((.((...(((((......((((((((..((.((((((........)))))).....))..))).))))).....)))))...)).)))).((((((((((((((((((((((...)))))...))))))))...(((((((.(((((((((...)))))...(((((((.........(((.((((..((((...))))..)))))))......((((.((....))))))((((((........)))).)))))))))..................))))...)))))))....)))))))))...).)))).(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((......).)))).....(((((((...)).(((......))).((..))(((((((.(((......)).).)))))))((..)).(..(((....).))..)(((((((.(((((..((..)...(((((((.((((((((((........)))).)))))).)))(((((...(((((((...((((...((.(((((.............)))))))....))))(((.(((..)))))).((((((........)))).)))))))))....).)))).)))))).)))).(((((..)..))))).))))))......(((.((((((.....))))).).))).)))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...................(.....................((((((........)))))).........................).............(((((((((.((((((((((((...)))))...)))))))....(((((((((....((((...))))....(((((((.........(((.((((..((((...))))..))))))).......(((.(......))))...((((........))))...)))))))......................)).)))))))....)))))))))..........(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(..((.(((.((...(((((......((((((((..((.((((((........)))))).....))..))).))))).....)))))...)).)))..(((((((((.((((((((((((...)))))...)))))))....((((((((((..(((((...)))))...((((((((........(((.((((..((((...))))..)))))))......((((.((....))))))..((((........))))..)))))))).....................))).)))))))....)))))))))))..).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...(((((......))))).(((..........(((....)))(((((........)))))....))).((((.....))))...((((....))))........((((..(((((........)))))....((((.((((........))))...((((.....)))).((((....))))....(((((.(((....))).(((((....))))).......((((.((....))))))..((((........)))).)))))........))))...............((((......))))...........))))...(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((......))))).(((..........(((....)))(((((........)))))....))).((((.....))))...((((....))))........(((...(((((....<<<<))))).....>>>>.(((....[[[.)))....((((.....)))).((((....))))]]].(((((.(((....))).(((((....))))).......((((.((....))))))..((((...{{{{{)))).)))))..............}}}}}........((((......))))(((.....))).)))...(((((.......))))))))))))....