RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00499

RNA: TMR_00499
Rfam family: tmRNA

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DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((((((.(((((((.((((....((((..((((((((.............((((((.............(((((............)))))..(((((((..........))))))).))))))......(((((.((((((((...)))).))))(((.((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))))).)))))....(((((((((.........)))))))))))))))))......((((((((((...)))))......))))).))))...)))))))))))..))))).)))))).)))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....)).(((((((((((.(((((((.((((.((.(((..(((((..(((((..........((.(((.(((.........(((((............)))))..(((((((..........)))))))((((((.((((((........))))))...))))))...(((.((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))))))))))).)).((((((((((......).)))))))))(((((........)))))((((((...))))))..))))))))))))).)))))))))))))..))))).)))))).)))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((((((.(((((((.((((.((.(((...((((..(((((...............(((...........(((((............)))))..(((((((..........)))))))((((((.((((((........))))))...)))))).......((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))...........(((((((((((.((....)))))))))))[[))............]])))..............))))))))).))).)))))))))))))..))))).)))))).)))))))....
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....)).(((((((((((.((((((.(((((.((.(((.((((((((((.............((((((.............(((((............)))))..(((((((..........))))))).))))))..(((((((((.((((((((...)))).))))....((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))....))))).))))((((((((.((....)))))))))).)))))))).))...(((((((((.....))))......)))))..))).)))))))))))))..))))).)))))).)))))))....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((((((.((((((..((((.((.(((.....(((((([[[..(((...)))(((((.............(((((............)))))..(((((((.(.......)))))))).))))).(((((({{{{{...))))))...))))))...(((.((((..((.((((((((((((((...))))))))))))))))..))))))).}}}}}....(((((((((.(......))))))))))(((((........)))))((((((...))))))..]]].......))).)))))).))))))..))))).)))))).)))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(.......)((((((((((((((((((.((((..(((((...)))))(((((((((......(((((((.(((.(..(......)(((.((......)).))).((.(((((((..........))))))).)))))))))).))).((..))...)))))))))...((((((((.......((((((((((((((...)))))))))))))).((.((......))))((((((((((((((.(((..))))))))))))..))))).))))).)))...(((.(((((..............).)))))))))))))))))).)))).))))))).)))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....)).(((((((((((.(((((((.((((.((.((((.(.(((((((.............((((((.............(((((.(........).)))))..(((((((..........))))))).))))))..(((((((((.(((((((.....))).))))(((.((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))))).))))).))))((((((((.((....)))))))))).)))))))..)....((((((((((...)))))......))))).)))).)))))))))))))..))))).)))))).)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....)).(((((((((((.((((((.(((((.((.(((.((((((((((.............((((((.............(((((............)))))..(((((((..........))))))).))))))..(((((((((.((((((((...)))).))))(((.((((.....((((((((((((((...))))))))))))))....))))))).))))).))))((((((((.((....)))))))))).)))))))).))...(((((((((.....))))......)))))..))).)))))))))))))..))))).)))))).)))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.((((.((((....))))))))...((((......)))).(((((....(((((..............))))).............(((((............)))))..(((((((..........))))))).(((((.((((((........))))))...))))).)))))..((((.....(((((((((((((.....)))))))))))))....)))).((((((.......))))))..))))))..((((..((((.((((........)))).(((((.....)))))..)))).)))).((((((........)))(((.......)))...))).......
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