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GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACAGGAUUCACGAAACCCUGGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCACCGUUAUAGUUGCAAACGACUCUAACUACUCUCUAGCAGCUUAGGCUAGCUAGCCAUCUGACACAGGUCUCUCAAAUGGGCAGUGUAUACAGAUGGUCAUCCUACAUUUGAUAGCGAGGGAACUCCGUCCGGGGGUGAACCGCGAAAUAGUACCGGACUCGCCCGAUGAAAUCCUGUCUUUCGGAGUUUAUUCGGGUUAAUUAAAAGAGAGACUAAGCAUGUAGUGCCUUGGAUGUAGGUGUUCUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.............(((((((((((...((..(((.(((((((((((.........)))))...................(((((....)))))...........((((((((....))).)))))(((((((((((..((((.......)))).))))...)))))))..................((.((..(((((.....)))))...)).))....(((.....))).((((((((((.(((........))).)))).))))))...................))))))....))).)).))).)).))))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).))).((((............))))((((((............))))))...((((.(((((....))))).))))......((((((((....))).)))))(((((((((((..(((.(......)))).))))...))))))).((.(((((((((......(((....))).((((((....................))))))..(((((((((.((((.(.....)))).)))).)))))).................((((((...)))).)))))))))))))........((((((....).)))))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((...........................((((............))))((((((............)))))).........((((....)))).....((((...(((((...........))))).((((((((((..((((.......)))).))))...)))))).....(((..............)))..((((....))))..............................((((((.(((........))).))))))...................((((......)))).........))))............................))))))).... |
|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....(((((....(((((.........((...))..(((((..((((((((((............)))))).........((((....))))..........((((.((.((........))...(((((..((((..(((.........))).)))).....))))).................)).))))........))..............................(((((((((..(((........)))...)))))))))...............))..)))))....................))))).......)))))........))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).)))..((((((....(((.(((((((((((............))))))...((((.(((((....))))).))))..)))))..))).))))))((((...((((((((((((..((((.......)))).))))...))))))))((.((((((((......(((((...(((.((((((.((....)).(......)..))))))..((((((((((.(((........))).)))).)))))).........)))..((((......)))).)))))))))))))))..))))..(((((.......)))))))))))).... |
|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).))).((((.((......)).))))(((((((..(((((....((..(((((((((.(((((....))))).))))..((((((((((((....))).))))((((((((((((..((((.......)))).))))...)))))))).........((((((.(.(((....))))((((((.((....))((......)).))))))..((((((((((.(((........))).))))).)))))..)))))).))))).((((((((...)))).)))).....))))).))....)))))..)))...))))))))))).... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).)))................................................((((.(((((....))))).)))).......(((((((....))).)))).(((((((((((..(((.........))).))))...)))))))..............................((((((.((....))...........))))))..((((((((((.(((........))).)))).))))))....................(((...))).......................(((((.......)))))))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).))).((((.((......)).))))((((((............))))))...((((.(((((....))))).))))......((((((((....))).)))))(((((((((((..((((.......)))).))))...)))))))...((((..............)))).....((((((....................))))))..((((((((((.(((........))).)))).))))))..............((((......)))).((..((((......)))).))..(((((.......)))))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((((((((....))))))).)))..((..(((((.....(((((((((((............))))))...((((.(((((....))))).))))..))))).((((((....))).))).((((((((((((..((((.......)))).))))...))))))))...((((((((..(....(((....))).((((((.((....))((......)).))))))..((((((((((.(((........))).)))).))))))...................((((...)))).)..)))))))).)))))))..(((((.......)))))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.....(((((((....))))))).....((((((.......)).)))).((((((((..........)))).))))....(((((....))))).......((((..(((.......))).((((........((((..((((.......)))).))))...((((((.........)))))).)))).)))).(((((.....))))).(((.((((.............))))..(((........)))...((((.....)))).))).........((((.(((......))).((((.......)))).))))....(((((.......))))).)))))).... |
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Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....(((((((....))))))).....((((((.......)).)))).((((((((<<<<<.....)))).))))....((((((................{{{{{.))))))..((((....)))).....((((..((((.......)))).))))...((((((.aaaaa...))))))...AAAAA(((((((([[[[[))))).....((((........]]]]]))))..}}}}}..))).((((...(((.....))).((((.......>>>>>))))..(((.....)))...)))).(((.....)))...(((((.......)))))))))))).... |
