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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00559



RNA: TMR_00559
Rfam family: tmRNA

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((..(...(((.((((((((((((((((((((....))))))))...(.((((((.......((((((...................((...((((......))))...))(((...(((((..............)))))...)))..................(((((...((((.....)))))))))))))))........)))))).)((((.(.((((..........))))...))))).......................)))))...))))))))))..)..)))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((........(...(((((((.....(((((((((((((....((((((((....))))))))....((((............((((((.(......).)))))).(((..((((......))))..)))(((...(((((..(((....)))..)))))...))).........))))...)))))))))))))((((((..(..(.......)..)...))))))..((((((((..((((((.((.((((((....((((....)))).....)))))).)).))))..))....)))))))).....))))))))..(((((.......))))))))))))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..........((((((........(((((((((((((....(((((..((((((..............)))))).......((((((..........))))))......((((......))))....)))))............((((((.....((((......))))..))))))...))))))))))))).)))))).((((((((((................(((((((((((......((((...)))))))))))))))...((((............(((((...)))))..))))..))))))...))))(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............(((((((.....(((((((((((((....((((((((....))))))))....((((........((((((..........................((((......))))...........(((((..............))))).))))))........))))...)))))))))))))..(((((..((((((((((............((((...))))....((((....((((((....((((....)))).....))))))....))))...)))))))))))))))...)))))))...(((((.......))))))))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((.((((.....(((((((..((((....(((((..(....)..)))))....((((........(((((......................(((..((((......))))..)))......(((((..((......))..)))))..)))))........))))...))))..))))))).((.(((..((((((((((.(..........((((...))))....((((.((.((((((....((((....)))).....)))))).)).)))).).))))))))))))).).).)))).))...(((((.......))))))))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((..(((.....(((((((..((((....(((((..(....)..)))))....((((........((((((((((....)))).........(((..((((......))))..)))......(((((..((......))..))))).))))))........))))...))))..)))))))..(..((..((((((((((........((..((((...)))).)).((((.((.((((((....((((....)))).....)))))).)).))))...))))))))))))..)...)))..))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((((((...((((............))))..((((....)))).(((((......)))))......)))).))))......((((((..........)))))).((((.((((......)))).((((.........))))...((((((.....((((......))))..)))))).(((.((((((((((.....)))).))))))....((((.((......))))))..(((.((((..........))))..((((....)))).)))..))).))))...(((.....))).((((.((((.....))))...(((((.......)))))...))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.......((((..aaaaa.....))))..((((....)))).(((((......)))))...AAAAA...)))...((((((((.[[[[.........))))...(((((((cccc..)))).CCCC.......((((.eee.eeee.eeee))))....EEEE.........)))...EEE.EEEE]]]].(((.........)))....((((.(({{{...))))))..((((..<<<..(((.dddd)))DDD(((....))).))))..D>>>..((((}}}...)))).bbbbbb...))))..BBBBBB..(((((.......))))).))))))....