RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00568

RNA: TMR_00568
Rfam family: tmRNA

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((............((((((((....(((((((((..(((((((((..{{{)))).....}}}....................................((.((.((((.........)))).)).))((((.((((.((((.<<<<<<)))))))..).)))).........>>>>>>....((((((((..aaaaa..))))))))..........AAAAA..(((((((((.(((....[[[[[[[))).))))))))).........]]]]]]]....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((.((.(((((((((((((((.(((...((..(((((....((.(((((....)))))))...............((((((((..((((.........))))))))))))...(((((.....((((((...((((((......))))))...)))))).......)))))..(((((..((((((....))))))..)))))..(((((((((.(((...........))).)))))))))........))))).))..)))))))))))...)))))))..))))))))))...(((((.......))))))))))...).)
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................((((.....))))......((.(((((....))))))).................(((((...((((.........)))).)))))((((.(..((((((.......))))))...).))))....................................................................................................................................................................................
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............(((((((.((((((((.....)))..)))))...(((.........)))((((((....))))))................((((((((..((((.........))))))))))))...(((((.....((((((........................)))))).......)))))..(((((..((((((....))))))..)))))..(((((((((.(((...........))).))))))))).....((((((((...(((......)))....))))))))....)))))))...(((((.......))))))))))))....
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((((...)))))....(((((.((...........)).........................((((.........)))).)))))((((....((((((.......)))))).....))))..((((((((((((............)))).))))))))......................(((((((((.(((...........))).)))))))))....................))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((((((((((.....)))..)))))...(((.........)))((((((....))))))................((((((((..((((.........))))))))))))...(((((.....((((((....((((........))))....)))))).......)))))..(((((.(((((((....))))))).)))))..(((((((((.(((...........))).))))))))).....((((((((.(.((((....)))).)..))))))))...))))))))...(((((.......))))))))))))....
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((.(((.((((((..((((((((.....)))..)))))...(((.........)))((((((....))))))................((((((((..((((.........)))))))))))).(((...)))..)))))).(((....))).(((((.........(((.((...((((((((.........))))))))...)).)))..))))).(((((((((.(((...........))).)))))))))..............(((((((....((((((..(((....)))..))))))..))))))).))).)))...)))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((.((([[[[[[[[.......)))...................((((((....)))))).................(((((((..((((.........)))))))))))..........((..{{{{{{.)).....................}}}}}}..............................................(((((((((.(((...........))).)))))))))...............................]]]]]]]]....))))))))...(((((.......))))))))))))....
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(..........((((((((.((.(((((((((((((((.(((.(.(...((((...(((.((((((....)))))))))...............(((((..(((((.........)))))))))).(((((((((((((.......))))))).))))))......(((.(((((.....((((((((((....)).))))))))..............)))))))).........................................))))..)).))))))))))...))))))))..)))))))))))..(((((.......))))))))))))....
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((....(((((((.....((((((...((((............((((((....))))))...................))))......(((((((....((((((((((..(((...)))...(((((...(((((((.........))))))))))))))))((((((((.........))))))))..............))))))...))))))).)))))))))))))...............((((((((((((...))))........))))))))...))))))))...(((((.......))))))))))))....
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RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....(((.((((.(.(((.(((..(((.(((..(((..........)))...)))....)))......)))....)))......)..........(((((...((((.........)))).)))))((((...(..(...........)......)..))))((.........((..(...((((((((.........)))))))).)....))....)).(........((.(((...........))).))..........)..........(((((....(((...(((((((........))))))).)))))))))))).)))...)))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((((((((....(((((((..((((((.((........((((.....(.((((((....))))))).................................................................................................................((((....(((........)))....))))................................................))))......)))))))).....)))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
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