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GGGGCUGACCGGUUUUGACAGCGGGCAGAAGUGGUUUGUAAGCAUGCAGUGCGUCGUUGGCCGGCACUUUAAUCUCGGUUGAUCCAAUUUUAACUGGCGAAAAUAACUACGCUCUCGCUGCUUAAUCGAAGCACAGUAGAUUGAAGCUUAAUCCUUACACAAGGUGUUUGGACGAGACAUCACCCGGAAGCCGUGGCUUCGAGGCAAUCCGAACCGGUGGUGCAGAAAUGUCGGAGAUAGCUUGACGGAUGUCCCGUACGGCAAGUGAAAAUUCAGGGAAUAAGGUUGCGGUGGGUGGCUUCGGUCUUGCCGCAGCACGAAAAUGAAGGCGAAGAUAAGCAUGUAGAAAGCAAAUUAGUUCCUCGUUUGGACGAGAGUUCGAAUCUCUCCAGCUCCACAU |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
|
Afold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..............((((..((...(((((((..((((((............................(((((((.......))))))).......................(((.......)))....................(......................((((.......(((((....))))).................................................))))........................)......(((((((((((..........)))))))))))......................)))))).....)))))))...)))))).......(((((.......)))))))))))).... |
|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.(((((.....(((((((((...(((.........)))....))).)))))))))))..((((((((((((((((.......)))))))((((..............))))(((((.....)))))....)))))))))(((..(((..((((...))))..))).))).(((((((((((.(((..........)))..))))....)))))))...........((((..(((.(((((.....)))).))))...(((....)))((((((...((((((((((....[[[..[[[)))))))))).................]]]]]]..................)))))).((((((((....)))))))).))))))))))).... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..((((((((.((..(((((.((..(((((........................................(((((((.......))))))).........))))).))))))).......(((((((......((((((...)))))).........((..(((((..(......)..)))))..))...))))))).....)).))))))))...(((....))).(((((..(((..((((.....))))..))).............((((((...(((((((..((..((....))))..)))))))............((........)).................))))))..(((((((....)))))))..))))).))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...((((.....[[[[[.))))...]]]]]((((.(((((....)))))...((((.....))))...(((((((.((((((.......)))))).((((..............)))).((((.....)))).....))))))).(((....((((....)))).((((bbb..))))aaaaa.aa(((((....)))))..)))..(((((..AAAAAAA.........)))))....(((...(((.....))).((.((........(((..{{{)))...(((((((((((...<<<<<..))))))))))).............>>>>>....))..))....))).........}}}.((((((((....))))))))...BBB....)))).. |
