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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00615



RNA: TMR_00615
Rfam family: tmRNA

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((.....(((((((((.((((((((((.........)))))................(((((.......)))))................(((((((.......)))))))(((((((((((..((.....)).....))))).)))))).................((((((((((((........))))))))))))................((((((((....(((........)))...))))))))....................)))))....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(..((..((((((((.(...((((((((((((((((((((.........))))).........(......(((((((.(((((....))))(((......((.(((((((.......))))))).))((((((((.((((.....))))..))))).)))((((......))))...)))((((((((((((........)))))))))))).....))))))))...(((((((((...(((.((())).)))..))))))))).....)..............))))))...)))))))))...))))))))))))(((((.......))))))))))))....
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Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((.....((((((((((((((((((((.........)))))...................(((((.((((....)))).)))))...((.(((((((.......))))))).))...(((((.(((.......)))..))))).(((((((......)))))))...((((((((((((........))))))))))))................(((((((((...(((........)))..)))))))))....................))))))...)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((...((((((((..((((...(((((.........)))))...........................))))..(((((((.........(((((((.......)))))))......(((((................))))).(((((((......))))))))))))))((((((((........))))))))...))))))))...((((((((((((((......(((((.....)))))))))))))...........................)))))).........))))))))...(((((.......))))))))))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((.....(((((((((((((((.((((((((((((((.......................(((((.((((....)))).)))))......(((((((.......))))))).............))))))))).))))).....(((((((......)))))))...((((((((((((........))))))))))))..(((((((.....((((.....))))...(((((.....)))))..)))))))...................)))))))...))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((.......)))(((((..((((((((.(.((((..((((......))))))))).)))).))))...((.....(((((.((((....)))).)))))...((.(((((((.......))))))).)).))...(((((((((((((.(((..(((..(((((((......)))))))...((((((((((((.(....).)))))))))))).((((((.(((.....(((((((((...(((.(....).)))..)))))))))........((.......))....))).))))))....)))..)))...))))))))))))).)))))...)))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...(((..((..(((((((((.((..((((.(.((((..((((......))))))))).))))..)))))))).....(((((.((((....)))).)))))...((.(((((((.......))))))).))...)))(((((((((((((.(((..(((..(((((((......)))))))...((((((((((((.(....).))))))))))))..........(((((((((((((((...(((.(....).)))..))))))))).............((........))..))))))....)))..)))...)))))))))))))))..)))..)))))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((...............((((...........................................................(((((.((((....)))).)))))...((.(((((((.......))))))).))......(((((((((((((..((..(((..(((((((......)))))))...((((((((((((.(....).))))))))))))....((..........(((((((((...(((.(....).)))..)))))))))............................)).......)))..))....)))))))))))))..))))...)))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((............((((((((.....(((((..(((((((((((((.........)))))....(((((((((...(((((((.((((.....(((((((......((.(((((((.......))))))).))...(((((.(((.......)))..))))).(((((((......)))))))))))))).(((((((........))))))).......)))))))))))...(((((((((...(((........)))..)))))))))..)))))).)))........))))))...))..)))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....)))).......(((((((............)))))))..)))..((((....)))).....(((((.......))))).(((((......((((..(((((.......)))))))))....(((((.(((.......)))..))))).(((((((......))))))).))))).(((((.....((((.....)))).......((((((......((((.....))))....(((((......))))).))))))........)))))............((((((((.....))))).))).....(((((.......))))).))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..{{{(((.....)))..{{{{.{{{{{{{.)))....((((}}}}}}}....)))).((((....))))....}}}}....((((....))))....}}}.((((..(((((.......)))))))))....(((((.(((.......)))..))))).(((((((......)))))))...((((((((((((..[[[[[.))))))))))))...(((...)))]]((((.....)))).....((((.<<<..))))((((>>>.....)))).................((((((((.....))))).)))]]]..(((((.......))))).))))))....