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GGGGCCGACCUGGCUUCGACGUGGGUCGCAAAGCAGCGUAGGGCAUACCGAGGGUCAGAGCACCUCGUAAAUCCAACUGAAAAACUUUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCCCUGGCCGCUUAAGGUCCAGGACUCACACUAGCCUGUUCAUGGGCUAGGCCGGGUCAAACCGGCAGUGAGUUAAUUCACAUGAAAUCGCGCUUGUCCGGGUCGCUUGGGCAGGUGCUAAAUCCAAGGCGGCUCGGCGAAAUCCAGCCUGUUCGGCGGGCGUGAUGGAGCUUAAAGCUUAAAAACACCGGACUAAGUAUGUAGAACUGCCUGUAGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........................................(((((.........)))))................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((.......)))))))))))).... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((.........)))))....(((......................................(((((((......))).))))((((((.((((((........))))))(((((......))))).)))))).............((((((((((.((((((((((((((...........))))).))))))))))........(((.....)))))))))))))))(((...)))..................))))).....))))))))....))))))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....(((.((((....))))...))).((((((((.....(((((((....)).))))).....))...........(((.((((....)))).))).))))))(((((((......)).)))))((((((.((((((((....))))))))(((((......))))).))))))....((....)).(((((((((((((((((((((((((...........)))).))))))))))(((............)))))))))))))).(((((...)))))............................((((.....))))........(((((.......)))))))))))).... |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((............(((((((......((((.((((.(((((((((((.........)))))...............................................((.............))...(((((.((((((........)))))).((((......))))..)))))..................(((((((((.((...)).)))))))))..................(((((.(((..(((.........)))..))).)))))........................))))))....)))))))).....)))))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.........................................(((((.........)))))......................((((....)))).............((((........))).).(((((((..(((((((....))))))).(((((......))))).)))))))............((.(((((((((((((...))))))))))))).))...............((((((((..(((.(.....).)))..))))))))..........................................................(((((.......)))))))))))).... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....(((.((((....))))...))).((((((.(..((.(((((((....)).)))))))...)................((((....)))).....))))))(((((((......)).)))))((((((.(((((((......)))))))(((((......))))).))))))....((....)).((((((((((.((((((((((((((...........))))).))))))))))........(((.....)))))))))))).(((((...)))))............................((((.....))))........(((((.......)))))))))))).... |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((((((......(((((((........((((((.......(((((.........)))))......................((((....)))).....)))))).((((...........))))))))))).(((((((((..))))))))))))))))....((((..((((((..)))))).....((((((((((((((((((((((.[[[[[............)))))))))))((((..........))))))))))))))).(((((...))))).......))))...............]]]]]......(((((((((..))))))))).........))))))).... |
|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Murlet(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.....((((((((....))))..))))....((((((....(((((.........)))))......................((((....)))).........)))))).((((....(((((..(((((((.((((((((....))))))))(((((......))))).)))))))...((((........(((((((((((((...))))))))))))).............(((((.((((..........)))).)))))))))..(((((...))))).........)))))..............((((.....))))..))))..(((((.......)))))))))))).... |
|
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((............(((((((......((((..(((..(((((..((..((((..................))))............((....(((.............((((.........))))...(((((......................................))))))))................(((((((((.....)..))))))))............)).....(((((.(((..(((.........)))..))).)))))....................))..))))).....))).)))).....)))))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((............((((((((.....((((.((((.(((((((((((.........)))))......................((((....))))...........(((((((......)).)))))((((((.(((((((......)))))))(((((......))))).))))))................(((((((((((((...))))))))))))).................(((...(((..(((((.....)))))..)))...)))........................))))))....))))))))....))))))))...(((((.......)))))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((....((..((((((((..((((.((((.((.((((((....(((((((....)).)))))......................((((....)))).........)))))))).))))..(((((..(((((((.(((((((......)))))))(((((......))))).)))))))............((((((((.(.((((((((((((((...........))))).))))))))))........(((.....))).)))))))).((((.....)))).........)))))..............((((.....))))..)))).))))...))))..))...))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((.....)))).((((....))))......(((((.((((....(((((.........)))))...........(((....))).((((....)))).........)))).((((......))))...(((((((.(((((((......)))))))(((((......))))).)))))))...............))))).((((((.(((((.((((....(((........))).)))))))))......(((((.....)))))......((((.....)))).......))))))......((((.....((((.....)))).))))...(((((.......)))))........... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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