RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - TMR_00617

RNA: TMR_00617
Rfam family: tmRNA

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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((............((..................................................................................................................................................................................................................))...(((((.......))))))))))))....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...............((((...(((.(((((((((((((......((((........)))).(....((((.(((..........(..((((((((.(((((((............))))))).......))))))))..).......))).))))...)...................((..(....)..))...)))))....))))))))..))))))).......(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((.((((((.(((.((((((((((((((((((...((((.....((((((...(((((..((((.(((.(....).))).)))).))))).)))))).((((((.(((.((((((((((.....(((((.(((.........)))))))).....)).)))))))))))...)))))))))).......)))))....))))))))....))))))))...))))...))))))))...)))))))....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((.......(((((..(((..(((((((((((((....(((((....((((...((((.....))))......)))).(((((((((((((((((((((.(((...)))..))))))))......))))))))...((((....))))......))))).)))))((((((.......)))))).......)))))....))))))))..)))))))).(((((....)))))..))))..)))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((.......(((((..(((..(((((((((((((......((((........))))......((((.(((........))).)))).((((.....(((.((((((.(((.((((((((((.....(((((.(((.........)))))))).....)).)))))))))))...)))))).)))..)))).)))))....))))))))..)))))))).(((((....)))))..))))..)))))))....
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((...((((.((((.(((((((((((((((((((..(((((...........(((.......)))(((........)))..((((((((((((((((.........[[.)))))))))......)))))))...((((....))))............))))).))]].....................)))))....))))))))....))))))))...)))).....))))))...)))))))....
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((((...................(((((((((((((....(((((...........((((.....))))...........(((((((((((((((((((((............)))))))))......))))))).(((((........)))))..))))).)))))((((((.......)))))).......)))))....))))))))....))))))......(((((.......))))))))))))....
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((......(((((..(((..(((((((((((((......((((........))))......((((.(((........))).))))....((((((((...[[[[[.[[[.[))))))))......((((......((((....))))))))...............]]]]...]]]]]............)))))....))))))))..)))))))).(((((....)))))).))))..)))))))....
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((.....((((.....((((((((((((((((((......((((........))))........(((((..............((((((((((((((((............)))))))))......)))))))...((((....)))).......((((........))))...)))))............)))))....))))))))....)))))......))))........))))..)))))))....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((................((..(((((((.((..(..)((((.((((((((....(((((((.((((((((((..))..)))))))).)).(((((((((((.......)).))))))))).......)))))...)..)))))))..((((...(((((........))))).))))...))))((((((...)))))))))))))))..)).)))))).....((((((.....)))))))))))))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((.......(((((..(((..((((((((...........((((........))))......((((.(((........))).))))..................................................((((....))))....................................................))))))))..)))))))).(((((....)))))..))))..)))))))....
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((.......(((((..(((..((((((((((.((((....((((........))))......((((.(((........))).))))....))))..((..((((((.(((.((((((((((.....((((......((((....)))))))).....)).)))))))))))...))))))..)).............)).))))))))..)))))))).(((((....)))))..))))..)))))))....
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.......)))).......((((..........))))..(((.....((((........))))......)))..((((...(((.((....))))).(((((((((............))))))))).........))))...((((....))))....(((((........((((((.......))))))..(((.....))).(((.....)))...))))).(((((.(((((.......)))))....)))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((....((((.......<<<<..)))).((((....>>>>.....))))...))).(((((((.....))).(((....(((.((....))))).((((((((([[[[[.[[....)))))))))...]]]]]]])))...((((....))))........((((.....{{{{{{.))))..}}}}}}.......(((.....))).)))).....))))).(((((.(((((.......)))))....)))))..

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