International institute of molecular and cell biology in Warzawa

Family AsrC


Download the aligments for this family. (.stk)

RNA Shape

Level1
(((((((((((((())))))))))(((())))()((((()))))))))()(((()(((((((())(((((((((())((((((()))))))((()))))))((()))))((((()))))())))))))))))
Level2
(()()()())()(()(()(((()()())())()())))

Consensus Secondary Structure representation

>predicted reference AsrC 
ACCCGAGCUUCCAUUUCACGGUCAGACAGGCCACCGCAGAUUUGGAUAAUACGGUCAGACAGCGUCGAUUUACCGUGGUCGAUGCGAGCAAUGAUCGAAAAGUUACGUAUGUUCUUCAUAGAGAUAAAUUAUUAUGCCUUACGCCUGGUUGACCAGACUUUAGAGGUCGCUGUUCUGAGCUUAACGUCUGUUUUAACUGAAACGCCGCACUCUACACUACAACGCUAAGGCGAGGAAAUGUUCAUAGUGUAAGGAGAGCGGGAACUGGAAAACGCCUCGCUUUUUUCCUGUAAAACACCGUAACGCAGGAAAAGCGCAUGCCUAUCGGGACAACAACCCAACGCGGCAGGUGCACCAUUGGGCGAAACGUUUACUGGCGCGUCUCGACUGAGGCAGUUUCGACGCGAACAAGGUCCGGCGGGAGGGCAACGUUUAAAAUCACGGGCUGCCAGGCGUCGCGCGCCGCCAGUUUUCGGGAAUAGCCGCGGGCAAUCAGAAAACCGCCCACGCCGCCCAGCACGGCACCGCUCAAUGCGGCAAGGUCAGGUCCAAACAGCACCUGAAAAAGCGCCGCAAAGAGAAAUAGCCCCGCUAAAGGCGACAUAUAGACCAGCAACGCCGAACCUAAAAGGCUUUUUUCGGCGAUGCCCAACCCGACUUUCUGCCCCGGCGCCAGCGGCUCCGCGCUUGGCACAACAAUGGUAUGCGCGGUCUGCGGCCCUAAUUUAUUCAGCACGCGACUGCCGCAUCCCGCACGGGAGGCGCAGCUGCUGCAUGACGCUUUAACGUCGCAGCCCACCACCGCCGGACCAUUCUGCCAGGAGACAACGGUCGCCCACUCUUUAAUCAUUGUGCUGCCCUGAAUUUGAUACUGUCGGCAAUGCGC
...((((((((((.(((..(((((..(((((....(((((((((((..(((((....(((....((((((.....((.(((...))).))..))))))...))).)))))..)))..........)))))....))).....)))))..)))))((((.((.(((.(((......))).))))).))))(((((....))))).((((.(((((((((((..(((....)))..).........))))))..)))).))))))).)))))...).))))...(((((((((.............)))))))))((((((((((((((((.......))).......((((.((((.(((((((((..((((..((((((((((..(((((...)))))..)))))......((((((((((..((((...............(((((((.(((((((((((((((.(((...(((((.......(.((((............)))).)..((((.(((..(((....(((..((((((....((((((.(.....).))))))......))))))..))).....)))..)))...))))............(((.((((((((((...))).....))))))).)))....)))))....)))...))))))..)))))..(((((.((.((......)).)).))))))))))))))))...........(((.(((.((((.((.((((....)))).)))))).))))))..((((......))))...))))....)))))))))).....))))).....)))).)))))))..........)).))))...)))).....)))).....))).))))))





Contribute: Everyone is welcome to give feedback concerning the database.
If you have any advice or suggestions for corrections or improvements, please : rnarchitecture@genesilico.pl

Copyright © Genesilico - All rights reserved