 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 7SK
RNA: 2KX8_A
| GGGAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUUCCC | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
(((((((((((((((((.....)))))..))))).))))))) ( ) |
|
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....))))..))))))..)))))) |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................................... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((...))))))..)))))).)))))) |
| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................((.....))......... |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................................... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....))))..))))))..)))))) |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........(((.....))....)................ |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..((((.((((.....))))...))))...)))))) |
| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......................................... |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..(((((((((.....)))))..))))...)))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((((((.....)))))..)))))...))))) |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(.........).............................. |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((.....)))))..)))))..)))))) |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(((((.((((.....))))...)))))..)))))) |