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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - GIR1
RNA: 4P8Z_A
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| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..(((((....((((((((.....))))........((.((....))))....))))...)))))......))))))))................((((....))))..))))))).))))))..))))) |
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| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........................................((((((((((((((.......((((........(((((....)))))...............................))))..(((.....))))))))))))........(((((....)))))...))))).............. |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((.......................(.......................)...............(((((................................))))).((((....))))..))))))).))))))..))))) |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((......................(((.....................)))......(((.....((((...........((.....))..............))))...))).........))))))).))))))))))))) |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((..........(((((((....(.(((((((.......((((....((.(((........))).))....)))))))))))).........))))))).........((((....))))..))))))).))))))..))))) |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((............((((((((.....)(((......((((....))))............))))))))))..))))))))..........(....)((((....))))..))))))).))))))..))))) |
| DAFS(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((..............................((((((((((((((......(((((........(((((...)))))......(....).....(((....))).....))))).((.......)))))))))))........(((((....)))))...)))))....))...))))) |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..((((....((((...((((...)))).......)))).......(((......)))........)))).))))))))................((((....))))..))))))).))))))..))))) |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((.(....(((..((((((((..(((((((((.....)))))......))))..))))...((((.(((....(((...))).....))).)))).(((((....))))))))))))....)))))))).))))))..))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..(((((....((((((((.....))))........((.((....))))....))))...)))))......))))))))................((((....))))..))))))).))))))..))))) |
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| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..........(((((((((((((.(....)))))))))).......((((.(.(((....)))).((.....(..)...))..)))).)).........))...((....))..........(....((....((((.(((...........(((((....)))).......)))).))))...))). |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................................................................................................................................................................ |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...............((....((((.((((.....)))).......))))....))...((((.(((....(((...))).....))).))))....(......)..(((....)))...))))))).))))))..))))) |
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| Multilign(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......)))))))))((((.((((((....)))))).))))......((((((.....)))))).....((((....)))).(((.(((((..((((((((.....)))).))......))..))))))))....................))))))..))))) |
| Murlet(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...................(((..((((((((..........(((((......(((....)))........................................(((....))).....)))))(((......)))))))))))(((((.((.............)).)))))....)))......... |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((...((((((.(((((((((.......))))))))).((((((((((((.((.....)))))...(((((((((.....)))))......))))((....)))))).(((((((((..((((.....))))))))((....)).)))))(((((....)))).)..))))).))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((.(...................(((((((((.....)))))......)))).........((((.(((....(((...))).....))).))))...(((....)))((((....)))).)))))))).))))))..))))) |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..(((((....((((.((((....))))........((((.....))))....))))...)))))......))))))))................((((....))))..))))))).))))))..))))) |
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| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..((((.....(((..((((.....)))........((.((....)))).....)..).)).....)))).))))))))................((((....))))..))))))).))))))..))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((....((((.(((((((((.......))))))))).(((((((...((((((((..((((.....(((((((((.....)))........((.((....)))).....)))).)).....)))).))))))))................((((....))))..))))))).))))....))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).(((((((((.((((((((..((((.....(((..((((.....)))........((.((....)))).....)..).)).....)))).))))))))...)))).....((..((((....))))))..))))).))))))..))))) |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((.(((((((((.......))))))))).((((((....(((((((.........................................................................)))))))................((((....))))...)))))).))))))..))))) |
| TurboFold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..((((((.(((((((((.......))))))))).((((((.((.((((......(((((........((((.....)))).......((((....)))).............))))).((((...)))))))).))...........((((....))))...)))))).))))))..)))). |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........(((((.(((((((((.......)))))))))....((((((...((((....)))).....((((.(((......)))........((((.....))))....))))..)))))).(((.....))).(((....(((....))).(((....))).))).......)))))........ |
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