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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - HIV_FE
RNA: 2L94_A
| GGGAAGAUCUGGCCUUCCCACAAGGGAAGGCCAGGGAAUCUUCCC | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ((((((((.((((((((((....))))))))))....)))))))) | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((((((((((((((((..))))))))))))...)))))))) | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Carnac(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Carnac(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................. |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(((((((((((......)))))))))))...)))))). |
| CentroidAlifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((..((((((((((((....))))))))))))....)))).. |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.((((((((((((....))))))))))))...)))))). |
| MXScarna(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.((((((((((((((((....)))))))))))))...))))). |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ............................................. |
| Mastr(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .(((((.((((((((((((....))))))))))))....))))). |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Multilign(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..((((((((((....)))))))))).....))))))) |
| Multilign(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Murlet(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......(((.((((((........)))))).))).......... |
| Murlet(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(((((((((((......)))))))))))...)))))). |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((((((((((......))))))))))(...)))))). |
| PETfold_pre2.0(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..(((((((((((......)))))))))))....))))). |
| PPfold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....(....(((((((((......)))))))))........)... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| RNASampler(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......((((((((((((....)))))))))))).......... |
| RNASampler(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......(((.((((((........)))))).))).......... |
| RNAalifold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.(((((((((((......)))))))))))...)))))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((...(((((((((((......))))))))))).....)))). |
| RSpredict(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.(.(((((((((((......)))))))))))...).)))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| TurboFold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| TurboFold(20) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....))))))))))))...))))))) |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((((((((....)))))))))))...)))))))) |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((((((((......))))))))))....))))))) |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.(((((((((((....)))))))))))....))))))) |