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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - K10_TLS



RNA: 2KE6_A

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((.(((((((((((((........))))))).))).))).)))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((.(((((((((((((.(....).))))))).))).))).)))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Alterna [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))))
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((((((((((.......)))))))))))).))))))..
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))).
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
Murlet(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((((((((((........))))))).)))))........
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((((........))))))).)))).))))))..
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))))).)))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
RNASampler(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))))).)))))))
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((((((((........))))))).)))).)))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))




RNA: 2KUR_A

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((((((((((....))))))))).))).)))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))))).)))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
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RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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RNA: 2KUU_A

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((.(((((((((((((((....))))))))).))).))).)))))
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
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RNA: 2KUV_A

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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))).
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
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PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))))).)))))))
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RNA: 2KUW_A

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Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((((((((.(....).))))))).))).)))))))))
                    (     )                     
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((..(((((((((((........))))))).)))).)..)))).
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((((((((((........))))))).)))).))))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))))
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).)))).))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((........))))))).....)))))))))
RNASampler(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((((........))))))).))).)))))))..
RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((((((((((........))))))).))))...))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((........))))))).))).)))))))))
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