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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - U5



RNA: 3JB9_C

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((((((((((((((......((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((((((((((((((......((...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))))).....)))))).)....................
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....)))))).....................)
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((..(((((((((((...........((((((((...........))))))))...))))))))))).......)))).......................
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((.(((((((........((((...((((((((...........)))))))).))))..)))))))......))))))...(.((..........)).).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((......((...((((((((.(.......).)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((.(((((((((((.......(...((((((((.(.......).)))))))).).)))))))))))......))))........................
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.......(((.[[[[[[[[)))........]]]]]]]]...)))))))))))).....))))))......................
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....))))))......................
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))......................
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((..((..[[))..((((((((...........))))))))..]]))))))))))).....))))))......................
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((.((((.(((...(...((...((((((((.(.......).)))))))).))))).))).)))).....).))))...............(.....)
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....))))))......................
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((...........((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))......................
Multilign(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(((((((((((......(((...(((((((.((........))))))))).)))))))))))))).............(((((...))))).......
Murlet(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..............................((((((((.(.......).))))))))................................................
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((([[[[[[[[[[.((((((((.[[...{{{{.))))))))...))))))))))))]]]].))))))]]].]]]]]...}}}}......
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((..(((((((((((......((...((((((((.(..(...)).)))))))).))))))))))))).......)))).......................
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((..(((((((((((......((...((((((((.(..(...)).)))))))).))))))))))))).......)))).......................
PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((.[[[[[[[[[[[[......((((((((...........))))))))((........)).)))))...)))))....]]]]]]]]]]]]......
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))......................
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((......(((...((((((((.(........))))))))).)))))))))))))).....)))))).((((((...))))).).....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .........................................................................................................
RNAalifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((.(.......)..............((((((((.(.......).)))))))).....................)))).......................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))......................
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))......................
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((.(.......).))))))))...)))))))))))).....))))))......................
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((..)))))(((((((((....(((((((((.((........))))))))((((......)))).(......)..)))...))))))))).((...)).
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((..)))))(((((((((....(..((((((.((........))))))))(((........))).(......)....)...))))))))).((...)).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))......................
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((((......(((...((((((((...........)))))))).)))))))))))))).....))))))......................
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((((((.((....))..((((((((...........))))))))...)))))))))))).....))))))......................
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((....)))).(((((((.(((....))).....(((((((....))).(((....)))..)))).(((..........))).)))))))..........
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ......(((((.....((((((........[[[[[[[[.)).))))...]]]]]]]].............))))).....((((....)))).............



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