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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - tmRNA

RNA: 3IYQ_A

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	N/A
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((.(((((((((...((((((((((((.(((((((.(.(((((((............)))))))..((((....))))................((((((........))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..))))))........)))))..))..).))))))))))))...((((.(((...)))....)))).....((((((((.(((((....)))))...))))))))..........(((((.......)))))...))))).)))).)))))).......(((((.......))))))))))))....
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((((((.(((((((((((.((((((((((((.(((((((.(((((((((............)))))))..((((....))))................((((((.(....).))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..)))))).......))))))..))..).))))))))))))...((((((((...))))...))))))((.((((((((.(((((....)))))...))))))))))........(((((.......)))))...))))).)))).)))))))).....(((((.......))))))))))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((.(((((((((...((((((((((((.((.((((((((((((((............)))))))..((((....))))................((((((........))))))))))).(((((((((((....)))))).))))).(((.(((.......))).))).)).)).))))))))))))...((((...(((...)))...)))).((.((((((((.(((((....)))))...))))))))))..((((...))))..((((....)))).))))).)))).)))))).......(((((......))))).)))))))....
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RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................(((((((.....................(((((.........)))))................................................................................(((((.........................))))).....((((.................))))....................(((((((((.(((........)))...)))))))))..........................................)))))))................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((....))..((((((((..((((((((((((.((.((((...(((((((............))))))).))))....(((((................(((((((.....).))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..))))))..........))).))..)).))))))))))))...(((((..((((((((...((((((((.((((((((.(((((....)))))...)))))))).....(((...((((.....))))))).)).)))).))...)))..)))))..)))))...))))))))..)))))))....
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.......((((((.(((((((((...((((((((((((.((.((((...(((((((............))))))).))))....(((((................((((((........))))))(((((((((((((((((....)))))).)))))..))))))..........))).))..)).))))))))))))...((((((((...))))...))))..((.((((((((.(((((....)))))...))))))))))..((((...))))..((((....)))).))))).)))).))))))))).((.(((((........)))))...)).....
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RNA: 3IZ4_A

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RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...........................(((..............)))((((((............))))))........((((....)))).....((((.............((((...........)))).............(((((((((((..................))))....)))))))......(((............))).......((((((.....................))))))..((((((((((.(((........))).))))))))))..............((((......)))).........))))............................)))))))...
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RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................(((((..............(((.((((((((((.........))))).......((((........((((....)))).........(.....((((.........................))))......(((((((((((..(((........)))..))))....)))))))..................).))))........(((((.....................)))))...((((((((...(((........)))...))))))))...................)))))....))).............)))))..............................
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RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.........(.........................................................................................................................................................................................................................................(.......(........................(.......)...................(....(........)..).....)............)).(((.(.......)).)))))))))...
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Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((.............((((((..(((..(((....)))..)))((((((............)))))).........))))))..............((((((((((...(((((.((....)))))))...))))))))))(((((((((((..(((........)))..)))))....)))))).....................................................((((.((((((..((((((((((.(((........))).))))))))))....)).....)))).))))...........................)))..(((((.......))))))))))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.............((..(((((((....((..(((((((((...(((((.....))))).......(((((........((((....))))..((((((((..(((((((((((((((.((....)))))))...))))))))))(((((((((((..(((........)))..)))))....))))))..........(((.....((((...((((((....))))))...)))).....))).....)).))))))....)))))..(((.(((.((((((....)))...)))...))).)))...))))))...)))..)).)))..))))..))...(((((.......))))))))))))...
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