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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - 5S_rRNA

RNA: CRW_00548

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RNA: CRW_00552

			CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
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RNA: CRW_00555

			ACACCCCCGUGCCCAUAGCACUGUGGAACCACCCCACCCCAUGCCGAACUGGGUCGUGAAACACAGCAGCGCCAAUGAUACUCGGACCGCAGGGUCCCGGAAAAGUCGGUCAGCGCGGGGGUUU
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RNA: CRW_00567

			AAUCCCCCGUGCCCUUAGCGGCGUGGAACCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGAAGUGAAACGCGCCAGCGCCGAUGGUACUGGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGUAGGUCGGUGCGGGGGAU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	..((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((....))))))))..)))))))...)))))))))).
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RNA: CRW_00570

			GGUUGCGGCCAUAUCUACCAGAAAGCACCGUUUCCCGUCCGAUCAACUGUGUUAAGCUGGUAGAGCCUGACCGAGUAGUGUAUGGGUGACCAUACGCGAAACUCAGGUGCUGCAAUCU
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RNA: CRW_00573

			UGCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGCAU
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RNA: CRW_01482

			ACGGUGCCCGACCCGGCCAUAGUGGCCGGGCAACACCCGGUCUCGUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCACGUCAGAACGGCCGUGAGGUCCGAGAGGCCUCGCAGCCGUUCUGAGCUGGGAUCGGGCACC
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RNA: CRW_01484

			AUUAGGGCGGCCAGAGCGGUGAGGUUCCACCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGUUAAGCUCGCCUGCGUUCUGGUCAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAAUCCAGUUCGCCGCCCCU
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RNA: CRW_01485

			UUAAGGCGGCCACAGCGGCGGGGCGACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGCAGAUAAGCCCGCCAGCGUUCCAGCGAGUACUGGAGUGUGCGAACCUCUGGGAAAACUGGUUCGCCGCCUCCC
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RNA: CRW_01487

			GGCAGCGGCCAUAGCGGUGGGGCGACACCCGUACCCAUUCCGAACACGGAAGUUAAGCCCACCAGCGUACCGGGAAGUACUGGAGUGAGCGAUCCUCUGGGAAGCGGGGUUCGCCGCCUGCCC
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RNA: CRW_01489

			UUAAGGCGGCCAUAGCGGUGGGGUUACUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCCGGUCAGUACUGGAGUGCGCGAGCCUCUGGGAAAUCCGGUUCGCCGCCUACU
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RNA: CRW_01491

			GGAGUUUGGCGCCAUAGCGGCAGUGUAACUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUACUGUACUGAAGUGUGCGAGCCUUCGGGAACUCUGGAUCGCUGCCAUACUCACC
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RNA: CRW_01492

			GGGUACGGCGACCAUAGCGGGGGGGCCACACCUGAACCCGUUCCGAUCUCAGAAGUUAAGCCCCCCUGCGUUGGAGGUGGUACUGCAACGUUAGUUGCGGGAAGCCUCCAACGUCGCCGGCCCA
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RNA: CRW_01493

			AGGUUGGCGGCCAUAGCGGAGGGGCCAUACCUGGUCUCGUUUCGAUCCCAGAAGUGAAGUCCUCCUGCGUUUUGUUGUUGUACUGUGGACGAGAGUCUAUGGGAAGCUCAUAACGCUGCCGGCCUC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((....))))))))))..))))))).))))))))))).
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RNA: CRW_01494

			UGGUACGGCGGUCAUAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAUCCCGAACUCGGAAGUUAAGCCCCCCAGCGAUGCCCCGAGUACUGCCAUCUGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCAC
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.(((((((.......(((((((.....((((.............)))).......))))))).....((((((.....(((((....)))))....))))))..))))))))))..

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RNA: CRW_01496

			GGGGCAUGGCGGUCAUGGCGCAGGGGUUAUACCUGAUCUCGUUUCGAUCUCAGUAGUUAAGUCCUGCUGCGUUGUGGGUGUGUACUGCGGUUUUUUGCUGUGGGAAGCCCACUUCACUGCCAGCCACU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((....((((((((((...))))))))))..))))))).)))))))))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((((....((((((((.(((...((((..(((...)))..))))....))).)))))).))...((((((.....(..((((.....))))..)...))))))...)))))))))).))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................................................................................................................................
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.(((((..(((((..[[[.))))).]]]{{{{)))))..}}}}.((((((.......))))))....((((((.....(((((((.....)))))))...)))))).....)))).......

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RNA: CRW_01497

			UGAUAUAACGGUCAUAGCGGAGGAGCCACAUCCGAUCCCGUCCCGAUCUCGGAAAUUAAGCCCUCCAGCGAUACCCUAAGUACUGCCAUUUGGUGGGAACAGGGUGACGCUGUUGAUCAC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((.(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...(((((((....)))))))..))))))).))))))))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(........(((((....(((((.((....(((((...((...))...)))))......))))))).(((.((((((.....(..((....))..)....)))))).)))...))))).)
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................................................................
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((......)))).((((((((.((....(((((.............)))))......)))))))........(((.....(((((....)))))....)))[[[[.))).....]]]]

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RNA: CRW_01498

			GGAGUUUGGCGGCCAUAGCGGCGGGGCAAUUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGAAGAUAAGCCCGCCUGCGUUCUAUACUGUACUAAAGUAUGAGAGUCUUUGGGAAAUAUGGAACGCUGCCAUCUCC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((..(((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((...((((((((.((....))))))))))..))))))).))))))).))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..((((.........((((((.(...((((((.............))))..))...))))))).((((((((((.....((((((.((....))))))))....)))))))))).)))).))))
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RNA: CRW_01499

			GAUCUGGCAGCCAUAGCGGCAGGUGUAAUCCUGUACCCAUCCCGAACACAGUAGAUAAGCCUGCCCGCGUUCCUUGCCUGUACUGAAGUGUGCGAGCUUCGGGAACUCUGGAUCGUGCCAUAUCAGU
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RNA: CRW_01500

			UUAAGGCGGCCAUCGCGGCGGGGUUCCUCCCGUACCCAUCCCGAACACGGAAGAUAAGCCUGCCUGCGUAUUGGUGAGUACUGGAGUGGGAGACCCUCUGGGAGAGCCGAUUCGCCGCCCCUACU
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RNA: CRW_01501

			GCCCCUAACCCGGCCAUAGGCGCCGGUGAUACGCCCGGUCUCAUCAGAACCCGGAAGCUAAGGCCGGCGCCGCGCUCGGGAGUACUGGGCUCCGCGAGGGCCCGGGAAACCGGCGUGCUGGGAGGGGGCUU
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RNA: CRW_01502

			UGGCCCGACCCGGCCAUAGCGGCCGGGCAACACCCGGACUCAUGUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGGCCGCGUUGGGGGAUGCUGUGGGGUCCGCGAGGCCCCGCAGCGCCCCCAAGCCGGGAUCGGGCCG
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RNA: CRW_01504

			GCCCACCCGGUCAGAGUGAGCGGGCAACACCCGGACUCAUUUCGAACCCGGAAGUUAAGCCGCUCACGUUAGUGGGGCCGUGGAUACCGUGAGGAUCCGCAGCCCCACUAAGCUGGGAUGGGUUUU
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RNA: CRW_01507

			GGCAACGGUCAUAGCAGCAGGGAAACACCAGAUCCCAUUCCGAACUCGACGGUUAAGCCUGCUGCGUAUUGCGUUGUACUGUAUGCCGCGAGGGUACGGGAAGCGCAAUAUGCUGUUACCACU
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RNA: CRW_01508

			GGUACGGCGGUCAUAGCGGCGGGGUCACACCCGGUCUCGUUUCGACCCCGGAAGUUAAGCCCGCCAGCGAUCCCGGUUGUACUGCCCUCCGGGAGGGGGCGGGAAGCCGGGGACGCCGCCGGCCACU
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RNA: CRW_01521

			UUUUGUUUGGUGCUAAUAUCGCUGUGGAAACACCUGGAACCAUCCCGAACCCAGCAGUUAAGCACAGUGGAGCUAAAUGUAGGUAGUAAUACUGAGAAUAGGUAAGCACCAAGCAAAA
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	...((((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((....))))..)))))))...))))))))))...
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RNA: CRW_01532

			GUCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGCACCGCUUCUCGUCCGAUCAGCAAAGUUAAGCAACGUUGGGUCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCAGAUGCUGUUGACUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01533

			GCCUACGACUAUACCACCAUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGUAUGGUAGGGCCGGGUCAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCCGGUGUUGUAGGCCU
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RNA: CRW_01534

			GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU
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			GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01536

			ACAUACGGCCAUAGAUUGAAGAAUAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUUCUAAUCGCCAAGUUAGUACUGCGGUGGGUGACCACGCGGGAAUCCUUGGUGCUGUAUGU
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RNA: CRW_01537

			GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU
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RNA: CRW_01539

			ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU
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RNA: CRW_01540

			GCUUACAGCCAUACUGUCCUGAGCACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGACAAGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACUGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAAGCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01541

			GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU
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RNA: CRW_01542

			GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.......(((.....))).((((............)))).((((..((........))..))))..(((((....)))))...((((((.....)))))))))))))))..

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RNA: CRW_01544

			GUUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCAUGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGCCCAUGUGCUGAUAGCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................................................................
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RNA: CRW_01548

			GCUUACGACCAUAUCACGUUGAAUGCACGCCAUCCCGUCCGAUCUGGCAAGUUAAGCAACGUUGAGUCCAGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCUGGAUGUUGUAAGCU
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RNA: CRW_01555

			GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUAGAUGAGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCUCGUCCACAACUUUUU
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RNA: CRW_01556

			GCUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAUGCACCGGAUCCCUUCCGAACUCCGAAGUUAAGCGGUUUAAGGCCUGUUAAGUACUGAGGUGGGGGACCACUCGGGAACUUCAGGUGCUGAUAGCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01557

			GUCUACAACCAUACCACGUUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUAGGGCUCGGUUAGUACUUAGAUGGGUGACCGCUUGGGAAUACCGAGUGUUGUAGGCUU
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RNA: CRW_01559

			GGCGUACGGCCAUACUACCGGGAAUACACCUGAACCCGUUCGAUUUCAGAAGUUAAGCCUGGUCAGGCCCAGUUAGUACUGAGGUGGGCGACCACUUGGGAACACUGGGUGCUGUACGCUU
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RNA: CRW_01562

			UGAUGCGGUCAUACCAAGGCUACUACACCAGAUCCCAUCAGAACUCUGAAGUUAAGCGCCUUUGGGCCGGAAUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUGCUGCAUCCAC
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RNA: CRW_01563

			AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU
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RNA: CRW_01566

			GGGUGCGAUAAUACCACCGCUAACGUAUCGGAUCCGAUCAGAACUCCGUAAUUAAGCGCGCUUGGGCUAGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCUCGGGAAGUCCUAGUGUUGCACCCAC
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RNA: CRW_01568

			GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGGGCCUGCCCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACAGCAGGUGUUGUAGACUU
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RNA: CRW_01569

			GCCUGCGGCCAUACCACGUUGAAUGCACCGGUUCCCAUCUGAACACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCAGCUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUCGCUGGUGCUGCAGGCUU
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RNA: CRW_01570

			GUCAACGGCCAUAGCACGCUGUAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCGUUGCGCGCGGUUAGUACCUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACCGCGUGCCGUUGACAU
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RNA: CRW_01572

			AUCUAUGGCUGUACCGCUCUGAACGUGCACUAUCUCUUCUGAUCUCAAAAGCUAAGCAGGGUCAGGCCUGGUUAGUACUGGAAUGGGAGACCACAUGGGAAAACUGGGUGCUGUAGGCU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((((..........)))).....(((......(((((...(((((.((((......)))).))))).......(((....)))..))))).....))).)))))))).)
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................................................................................................
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RNA: CRW_01573

			GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))...
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................
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RNA: CRW_01578

			GUUUACGACCAUACCAUGCUGAAUAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAGCAUAGGGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUGUAGGCAU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).))(((((((...(.((..(.(((....))).)..)))..))))))))))))))..))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................................................................
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RNA: CRW_01580

			GCUUACGGCCAUAUCACGCUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUAGAGCCUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUAGGUGCUGUAAGCAU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01581

			ACACACGGCCACAGUCAGCUGAAAACUGGGCAUCCCGUCCGCUCUGCCAUACAUAAGCAGUUGAACGGCAGAUUAGUACCACGGUGGGUGACCACCUGGGAAUCCCUGCUGCAGAGUGUU
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RNA: CRW_01583

			AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU
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RNA: CRW_01584

			GUCUACGACCAUAUCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCGUGGUUAGUACGUGGAUGGGUGACCGCCUCGGAAUACCACGUGUUGUAGGCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01590

			GGGUGCGAUCAUACCAGCGUUAGUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGCGCUUGGGCCGGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUAUUGCACCCUU
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RNA: CRW_01593

			GUCUACGACCAUACCACAAUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAUUGUCGGGCCAGGAUAGUACCUGGAUGGGGGACCGCCUGGGAACGCCUGGUGUCGUAGACUU
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RNA: CRW_01595

			GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU
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RNA: CRW_01599

			GCCUACGGCCAUACUACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCUGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGGUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................................................................
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RNA: CRW_01603

			AGAUGCGAUCAUACCAGCACUAACGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGCUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUGGAAUGGGUGACCCUCCGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUCCCG
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RNA: CRW_01605

			GAUAGCGUCCAUACCACACUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGCAGUUAAGCAGUGUCGGGCCCAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACUGGGUGUCGCUACCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01606

			GUUGGUGGCCAUACUAAGCCUAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCGAGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGACAACCC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01608

			GGGUACGACCAUACUUGGCUGAAAGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCAGCCACAGGCUUAGUUAGUACUGAGGUCAGUGAUGACUCGGGAACCCUGAGUGCCGUACCCUCCACAACACUC
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RNA: CRW_01613

			ACAGCCGUUCAUACCACACGGAGAAUACCGGAUCUCGUUCGAACUCCGCAGUCAAGCCGUGUCGGGCGUGCUCAGUACUACCAUAGGGGACUGGGUGGGAAGCGUGCGUGACGGCUGUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
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RNA: CRW_01616

			GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUU
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RNA: CRW_01617

			GCCUACGGCCAUACCACGUAGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCUGCGUCGGGCGUGGUUAGUACUUGCAUGGGAGACCGGCUGGGAAUACCACGUGCUGUAGGCUU
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RNA: CRW_01620

			GUCUACGGCCAUACCUAGGCGAAAACACCAGUUCCCGUCCGAUCACUGCAGUUAAGCGUCUGAGGGCCUCGUUAGUACUAUGGUUGGAGACAACAUGGGAAUCCGGGGUGCUGUAGGCU
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RNA: CRW_01621

			GGAUGCGAUCAUACCAGCACUAAGGCAUCGGAUCCCGUCAGAACUCCGAAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACAAGGAUGGGUGACCUCUUGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUUCCC
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
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RNA: CRW_01623

			GGGUACGACCAUACUUGGCCGAGUGCACCACAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCGGCCACAGGCCUCGUUAGUACGGCGAUCAGUGAUGGCGCUGGAACCCGGGGUGCCGUACCCUU
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RNA: CRW_01625

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........................................................................................................................
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