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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RNase_MRP

RNA: RFA_00621

			AUCGUCACUAAUCGAAGCUUACAAAAAUGGAGUAAAGGAAUUUUUCUUCUUACUCAAUAUUAAUGCUUUGGGUUGAAAGUCUCCCACCAAUUCAUAUGCGGAAAACGUAAUGAGAUUUAAAAAAUUUAAAUUCUUUAAAUCAACUCAUUAAGAGAAAUAUCUUUAGAUAUUUCUCUUCUUGACCCAGUACUCUGUUACAGGAGCGCUGGUGUUUUCUUCGGUACUGGAUUCCUUAUAUAUGGAAUCUAAACCAUAGUUAUGACGAUUGCUCUUUCCCAUGCUGGAUCGAGUAACCCAAUGGAGCU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((....(((((((...........((((((..............)))))).........)))))))...................((((....)))).....((((((((((((((((((...)))).)))))))...))))))).((((((((((....(((((........(((....((((....)))..)))))))))))))))))))...........((((........))))...............)))))))..((((((((......))))))))...............
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Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.((((.(((((...........(((((((((((...))))).)))))).........)))))(((..........))).......(((.((((.....))))))).((((((((.(((....))).))))))))...(((..((((((((((((....))))))))))))..))).(((((.((((......)))).)))))..........(((..((((((((........)))))))).)))...))))))))))).(((((......((((......)))).......))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.....((((((...........((((((((((.....)))).)))))).........)...((((..........))))......(((.((((.....))))))).((((((((.(((....))).))))))))...(((..((((((((((((....))))))))))))..))).(((((.((((......)))).)))))......)))))((..((((((((........)))))))).))........)))))))(((((..(((......)))..))))).............
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Multilign(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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RNA: RFA_00623

			AUCGUCACAAAUCGAAGCUUACAAAAUGGAGUAAAAUUUUUUUUACUCAGUAAUAUGCUUUGGGUUGAAAGUCUCCCACCAAUUCGUAUGCGGAAAACGUAAUGAGAUUUAAAAAUUCUAAAUUGUUUAAAUCAACUCAUUAAGGAGGAUGCCCUUGGGUAUUCUGCUUCUUGACCUGGUACCUCUAUUGCAGGGUACUGGUGUUUUCUUCGGUACUGGAUUCCGUUUGUAUGGAAUCUAAACCAUAGUUAUGACGAUUGCUCUUUCCCGUGCUGGAUCGAGUAACCCAAUGGAGCU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((....(((((((..........((((((........))))))........)))))))...................((((....)))).....((((((((((((((((((...)))).)))))))...))))))).((((((((((....(((((........(((....((((....))))..))))))))))))))))))...........((((((....))))))...............)))))))..((((((((......))))))))...............
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Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((((...((......((((((((....))))))))..(.....)...((((..........))))......(((.((((.....))))))).((((((((((((...)))).))))))))...(((..(((.((((((((....)))))))).)))..))).(((((((((........))))))))).))...)))))))..((((((((((....)))))))))).((....))..))))))).(((((......((((......)))).......))))).
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Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((......(((((..........((((((((....))))))))........(((.{{{{.....)))..}}}}....((((....)))).....((((((((((....)))..(((.....)))......))))))).[[[(((((((....))))))).)))))....((((.....]]]....))))(((((((........))))))).(((((((((....)))))))))............))))))..(((((......((((......)))).......))))).

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RNA: RFA_00624

			ACCUGAAGUCUAGGCAACGUACGGGAGACGUAGUUCUUCAAUCACAUGACGCCUAGGGGAAAGUCCCCGGAUCUCGGGUAGAAAGUGCCGUGCGCUACUAUGGCGUGCAAUAAUCCCGCCCUGCUGUCCAUAUCAACCCGCCAAGAAGCUCCCAGAGCCGAGCGGCUUGGAUUAGGGCGGGAUCUCUCAUCAGUCACCAUAGUAACUCAGGUAGCGCGGCAACGUCCACGCUAACUAAACGGGGCU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((..(((((((.......((((((....))))))............)))))))...................((((.....))))((((((((....)))))))....(((((((((((..(((((.......((((......((((...))))...))))..))))))))))))))))......................))))))).((((((......))))))...............
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Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................................................................................................................................................
CMfinder(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................................................................................................................................................
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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((.((((.((((.......))))......(((......))).)))).(((((...))))).))..))))))......((((((((((((((((((.(((.....(((((((((((..((........))...(((((..((((........))))..)))))..)))))))))))....)))......)))))))......))).))))))))..((((.((.........)))))).
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................................................................................................................................................
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