RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - Y_RNA

RNA: RFA_00582

			GGCUGGUCGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUGUUCACAGUCAGUUACAGAUCGAACUCCUUGUUCUACUCUUUCCCCCCUUCUCACUACUGCACUUGACUAGUCUU
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RNA: RFA_00583

			GGCUGGUCCGAGUGCAGUGGUGUUUACAACUAAUUGAUCACAACCAGUUACAGAUUUCUUUGUUCCUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGCCUU
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RNA: RFA_00584

			AGUUGGUCCGAGUGUUGUGGGUUAUUGUUAAGUUGAUUUAACAUUGUCUCCCCCCACAACCGCGCUUGACUAGCUUG
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RNA: RFA_00585

			GGCUGGUCCGAAGGCAGUGGUUGCCACCAUUAAUUGAUUACAGACAGUUACAGACUUCUUUGUUCUUCUCCCCUCCCACUGCUUCCCUUGACUAGCCUU
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RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((...(((((((((..........((((((........)))))).(((............)))......))))))))).....))))))))..
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RNA: RFA_00586

			GGUUGGUCCGAAAGUUGUGGGUUAUCCAAAUCAUUCAGUUAGUAUCACUAACCUUCUAUUUCACCCCACUGCUGACCUUGACUGGCCAA
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((.............................................))))))).......))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((....(((.(((((................((((((...))))))............))))).)))......))))))))..
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RNA: RFA_00587

			GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((..(((((((..........((((((((....))))))))..((................))....))))))).))....)))))).))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((..(((((((.((((.....((((((((....)))))))).)))).....................))))))).))....)))))))).
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RNA: RFA_00588

			GGCUGGUCCGAAAGUAGUGGGUUAUCACAGAAAUUAUUACAGUUAGUUUCACUAACCUUUCUAAGUUCCACCCCACUGCUAACCUUGACUGGUCUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((....................................................))))))).......))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((....(((((((((........(((((((.......)))))))...(((........)))....)))))))))......)))..).).)
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((....(((((((((.......(((((........((((((...)))))).))))).........)))))))))......))))))))..
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UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((....(((((((((........(((((((.......)))))))...(((........)))....)))))))))......)))..)))..
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(((((..((((....)))).(((((((.......)))))))......))))).(((..................))).)))))))..

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RNA: RFA_00589

			GGCUGGUCCGAUGGUAGUGGGUUAUCAGAACUUAUUAACAUUAGUGUCACUAAAGUUGGUAUACAACCCCCCACUGCUAAAUUUGACUGGCUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((..................................................))))))).......))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..(((.((((((((((((...........(((((((.((((.....)))).)))))))........)))))))))..))).)))..)..))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.((((((((((((((.........(((((((.(((((...))))).)))))))...)))...))))))))..))).))))))))..
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RNA: RFA_00594

			AGUUGGUCCGAAGGUUGUGGGUUAUCGUUAUUGAUUUAAUAUUGUCUCCCCCCACACCCCCUCUUGACUAGCUUU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((...............................))))))).......))))))))..
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RNA: RFA_00596

			GGCUGGUUGGAAGGUAGUGAGUUAUCUCAAUUGAUUAUUCACAGUCCGCUACAGAUUGAACUCCUGUUCUAUACUUUUUCCACUUCUCACUUCUGCACAUGACUAAGGAU
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((.....(((((((..................................................................))))))).......))))))))..
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((.(((((...((((((.(((......))).))))))...............((((....)))).............))))).)))...)).............)
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