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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Alterna
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
CMfinder(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................(((((.(...((((....)))).....).))))).(............).................((((((....))))))...................... |
|
CMfinder(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....(((.((((((((((....)))))))))).......(((((((...((((....)))).....)))))))))).(((((((..((......(((((......((((((....))))))........)))))))))))))) |
|
Carnac(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....)))))))))).......(((((((....................)))))))....(((((((..........((((((.....((((((....)))))).......))))))..))))))) |
|
Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........((((((((((....))))))))))........(((((....(((.........)))...)))))(((((.......))))).....(((((......((((((....))))))........)))))......... |
|
CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((((((....))))))))).........((((((...((((....)...)))..))))))(((((.......))))).....((((((.....((((((....)))))).......))))))......... |
|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......(((((((((((((())))))))))))..))...(((((((((.((((....)))).))..)))))))....(((((((..((......((((((.....((((((....)))))).......))))))))))))))) |
|
Cylofold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........(((((((((......)))))))))........((((((...(((.........)))..))))))(((((.......)))))....(((((((.....((((((....)))))).......)))))))........ |
|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
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|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
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|
MCFold
(ext)
|
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MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
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|
Multilign(seed)
|
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|
Multilign(20)
|
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Murlet(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
Murlet(20)
|
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[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
NanoFolder
|
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PETfold_2.0(seed)
|
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
PETfold_pre2.0(seed)
|
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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|
Pknots
|
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PknotsRG
|
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ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
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|
RDfolder
|
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............................................................................................................................................... |
|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNASampler(seed)
|
[ FASTA input ] |
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RNASampler(20)
|
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RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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............................................................................................................................................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
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.....((.((((((((........)))))))).....))...(..(.(.((((....))))...).))....(((..((.....)))))((...((.........((((((....))))))..........).).))...... |
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RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Sfold
|
[ FASTA input ] |
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TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
............................................................................................................................................... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((....))))))))))..(((..(......)..)))......)))))..(((((.((((((.......))))))....((((((.....((((((....)))))).......))))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((.(((((((((....))))))))).............((((....))))..)))))..((((..((((((.......))))))....((((((.....((((((....)))))).......)))))).)))).... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((((((((((((((....))))))))))....[[[[[[..((((....))))..)))))..]]]]]]((((((..{{{{{))))))....((((((.....((((((....)))))).......))))))..}}}}}.. |
